RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438357.1

RPS6KA3-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA3, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPS6KA3-202ENST00000438357 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
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RPS6KA3-202ENST00000438357 SCRIBQ14160 1630 aa30.27■■■□□ 2.44
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RPS6KA3-202ENST00000438357 SMARCA2P51531 1590 aa28.84■■■□□ 2.21
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RPS6KA3-202ENST00000438357 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA3-202ENST00000438357 ERCC6Q03468 1493 aa28.64■■■□□ 2.17
RPS6KA3-202ENST00000438357 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.6■■■□□ 2.17
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RPS6KA3-202ENST00000438357 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.54■■■□□ 2.16
RPS6KA3-202ENST00000438357 CUX2O14529 1486 aa28.54■■■□□ 2.16
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RPS6KA3-202ENST00000438357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.43■■■□□ 2.14
RPS6KA3-202ENST00000438357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.31■■■□□ 2.12
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RPS6KA3-202ENST00000438357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.18■■■□□ 2.1
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RPS6KA3-202ENST00000438357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.09■■■□□ 2.09
RPS6KA3-202ENST00000438357 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA3-202ENST00000438357 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA3-202ENST00000438357 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA3-202ENST00000438357 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.83■■■□□ 2.04
RPS6KA3-202ENST00000438357 WDR62O43379 1518 aa27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA3-202ENST00000438357 CFTRP13569 1480 aa27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA3-202ENST00000438357 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.79■■■□□ 2.04
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RPS6KA3-202ENST00000438357 OSCARQ8IYS5 282 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS6KA3-202ENST00000438357 TOPBP1Q92547 1522 aa27.26■■□□□ 1.96
RPS6KA3-202ENST00000438357 IFT140Q96RY7 1462 aa27.26■■□□□ 1.95
RPS6KA3-202ENST00000438357 ABCC8Q09428 1581 aa27.25■■□□□ 1.95
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRIM41Q8WV44 630 aa27.24■■□□□ 1.95
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
RPS6KA3-202ENST00000438357 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.18■■□□□ 1.94
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RPS6KA3-202ENST00000438357 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA3-202ENST00000438357 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA3-202ENST00000438357 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA3-202ENST00000438357 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA3-202ENST00000438357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 CUX1P39880 1505 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 FBLN2P98095 1184 aa26.82■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGEF11O15085 1522 aa26.8■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 CHD1O14646 1710 aa26.79■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA3-202ENST00000438357 WDR97A6NE52 1622 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KA3-202ENST00000438357 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA3-202ENST00000438357 GRIN2BQ13224 1484 aa26.65■■□□□ 1.86
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RPS6KA3-202ENST00000438357 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
RPS6KA3-202ENST00000438357 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KA3-202ENST00000438357 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
RPS6KA3-202ENST00000438357 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA3-202ENST00000438357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARAP1Q96P48 1450 aa26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA3-202ENST00000438357 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA3-202ENST00000438357 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.51■■□□□ 1.83
RPS6KA3-202ENST00000438357 PBRM1Q86U86 1689 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS6KA3-202ENST00000438357 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
RPS6KA3-202ENST00000438357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.47■■□□□ 1.83
RPS6KA3-202ENST00000438357 TOP2BQ02880 1626 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS6KA3-202ENST00000438357 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.4■■□□□ 1.82
RPS6KA3-202ENST00000438357 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RPS6KA3-202ENST00000438357 GRIN2AQ12879 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
RPS6KA3-202ENST00000438357 ADAMTS12P58397 1594 aa26.28■■□□□ 1.8
RPS6KA3-202ENST00000438357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS6KA3-202ENST00000438357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.22■■□□□ 1.79
RPS6KA3-202ENST00000438357 NUP160Q12769 1436 aa26.2■■□□□ 1.78
RPS6KA3-202ENST00000438357 CEP170Q5SW79 1584 aa26.17■■□□□ 1.78
RPS6KA3-202ENST00000438357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.09■■□□□ 1.77
RPS6KA3-202ENST00000438357 SHROOM2Q13796 1616 aa26.04■■□□□ 1.76
RPS6KA3-202ENST00000438357 JPH4Q96JJ6 628 aa25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA3-202ENST00000438357 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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