Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WNT3AP56704 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WNT3AP56704 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WNT3AP56704 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT3AP56704 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WNT3AP56704 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT3AP56704 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WNT3AP56704 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WNT3AP56704 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WNT3AP56704 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WNT3AP56704 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WNT3AP56704 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT3AP56704 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WNT3AP56704 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WNT3AP56704 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WNT3AP56704 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WNT3AP56704 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WNT3AP56704 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WNT3AP56704 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
WNT3AP56704 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WNT3AP56704 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WNT3AP56704 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WNT3AP56704 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WNT3AP56704 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WNT3AP56704 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
WNT3AP56704 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WNT3AP56704 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WNT3AP56704 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WNT3AP56704 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WNT3AP56704 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms