Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AIF1P55008 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AIF1P55008 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AIF1P55008 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AIF1P55008 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AIF1P55008 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AIF1P55008 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AIF1P55008 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AIF1P55008 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AIF1P55008 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AIF1P55008 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AIF1P55008 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AIF1P55008 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AIF1P55008 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AIF1P55008 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AIF1P55008 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AIF1P55008 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AIF1P55008 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AIF1P55008 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AIF1P55008 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AIF1P55008 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AIF1P55008 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AIF1P55008 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AIF1P55008 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AIF1P55008 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AIF1P55008 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AIF1P55008 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AIF1P55008 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AIF1P55008 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AIF1P55008 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AIF1P55008 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AIF1P55008 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AIF1P55008 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AIF1P55008 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AIF1P55008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AIF1P55008 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AIF1P55008 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
AIF1P55008 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AIF1P55008 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AIF1P55008 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AIF1P55008 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AIF1P55008 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AIF1P55008 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AIF1P55008 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AIF1P55008 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AIF1P55008 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIF1P55008 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIF1P55008 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIF1P55008 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIF1P55008 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
AIF1P55008 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AIF1P55008 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AIF1P55008 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AIF1P55008 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AIF1P55008 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AIF1P55008 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AIF1P55008 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AIF1P55008 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AIF1P55008 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AIF1P55008 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AIF1P55008 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIF1P55008 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIF1P55008 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AIF1P55008 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AIF1P55008 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AIF1P55008 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AIF1P55008 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AIF1P55008 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AIF1P55008 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AIF1P55008 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AIF1P55008 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AIF1P55008 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AIF1P55008 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AIF1P55008 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AIF1P55008 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AIF1P55008 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIF1P55008 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIF1P55008 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AIF1P55008 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AIF1P55008 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AIF1P55008 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AIF1P55008 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AIF1P55008 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AIF1P55008 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AIF1P55008 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AIF1P55008 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AIF1P55008 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AIF1P55008 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AIF1P55008 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AIF1P55008 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AIF1P55008 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AIF1P55008 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AIF1P55008 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AIF1P55008 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AIF1P55008 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AIF1P55008 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AIF1P55008 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AIF1P55008 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AIF1P55008 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AIF1P55008 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms