Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A8P48029 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A8P48029 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A8P48029 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A8P48029 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC6A8P48029 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A8P48029 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A8P48029 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A8P48029 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A8P48029 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A8P48029 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A8P48029 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A8P48029 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A8P48029 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A8P48029 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A8P48029 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A8P48029 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A8P48029 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A8P48029 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms