Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCN1P31025 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN1P31025 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN1P31025 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN1P31025 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN1P31025 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN1P31025 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN1P31025 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN1P31025 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN1P31025 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN1P31025 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN1P31025 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN1P31025 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN1P31025 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCN1P31025 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P31025 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P31025 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P31025 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN1P31025 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCN1P31025 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN1P31025 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN1P31025 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN1P31025 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCN1P31025 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN1P31025 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCN1P31025 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCN1P31025 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P31025 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P31025 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P31025 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCN1P31025 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCN1P31025 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCN1P31025 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LCN1P31025 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN1P31025 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCN1P31025 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN1P31025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCN1P31025 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCN1P31025 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCN1P31025 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN1P31025 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN1P31025 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCN1P31025 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LCN1P31025 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCN1P31025 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN1P31025 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN1P31025 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCN1P31025 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN1P31025 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN1P31025 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN1P31025 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P31025 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P31025 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P31025 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCN1P31025 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCN1P31025 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCN1P31025 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCN1P31025 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN1P31025 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCN1P31025 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCN1P31025 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCN1P31025 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCN1P31025 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCN1P31025 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN1P31025 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN1P31025 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN1P31025 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCN1P31025 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCN1P31025 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN1P31025 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN1P31025 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN1P31025 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCN1P31025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCN1P31025 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCN1P31025 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCN1P31025 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCN1P31025 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCN1P31025 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCN1P31025 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCN1P31025 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCN1P31025 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LCN1P31025 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCN1P31025 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCN1P31025 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCN1P31025 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCN1P31025 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCN1P31025 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCN1P31025 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCN1P31025 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LCN1P31025 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCN1P31025 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN1P31025 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN1P31025 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN1P31025 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P31025 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P31025 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN1P31025 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LCN1P31025 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCN1P31025 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCN1P31025 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms