Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LCN1P31025 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LCN1P31025 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LCN1P31025 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LCN1P31025 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LCN1P31025 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LCN1P31025 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LCN1P31025 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LCN1P31025 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LCN1P31025 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LCN1P31025 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LCN1P31025 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCN1P31025 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LCN1P31025 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCN1P31025 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCN1P31025 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCN1P31025 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LCN1P31025 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCN1P31025 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCN1P31025 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LCN1P31025 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LCN1P31025 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LCN1P31025 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCN1P31025 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LCN1P31025 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LCN1P31025 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LCN1P31025 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LCN1P31025 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LCN1P31025 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCN1P31025 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCN1P31025 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LCN1P31025 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCN1P31025 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LCN1P31025 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LCN1P31025 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LCN1P31025 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LCN1P31025 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LCN1P31025 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LCN1P31025 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCN1P31025 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCN1P31025 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCN1P31025 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCN1P31025 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCN1P31025 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCN1P31025 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCN1P31025 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCN1P31025 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCN1P31025 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCN1P31025 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCN1P31025 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCN1P31025 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCN1P31025 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LCN1P31025 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LCN1P31025 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LCN1P31025 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LCN1P31025 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LCN1P31025 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LCN1P31025 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LCN1P31025 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LCN1P31025 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LCN1P31025 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCN1P31025 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LCN1P31025 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LCN1P31025 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LCN1P31025 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LCN1P31025 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LCN1P31025 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LCN1P31025 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCN1P31025 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LCN1P31025 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LCN1P31025 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCN1P31025 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCN1P31025 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LCN1P31025 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LCN1P31025 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LCN1P31025 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LCN1P31025 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LCN1P31025 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LCN1P31025 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCN1P31025 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LCN1P31025 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCN1P31025 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCN1P31025 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCN1P31025 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCN1P31025 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCN1P31025 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCN1P31025 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LCN1P31025 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCN1P31025 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCN1P31025 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LCN1P31025 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCN1P31025 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCN1P31025 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LCN1P31025 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LCN1P31025 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCN1P31025 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LCN1P31025 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LCN1P31025 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCN1P31025 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCN1P31025 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms