Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD1BP29016 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD1BP29016 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD1BP29016 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD1BP29016 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD1BP29016 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD1BP29016 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD1BP29016 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD1BP29016 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD1BP29016 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD1BP29016 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD1BP29016 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD1BP29016 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD1BP29016 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD1BP29016 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD1BP29016 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1BP29016 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1BP29016 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1BP29016 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1BP29016 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1BP29016 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1BP29016 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1BP29016 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1BP29016 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1BP29016 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1BP29016 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1BP29016 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1BP29016 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1BP29016 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1BP29016 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1BP29016 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1BP29016 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1BP29016 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD1BP29016 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1BP29016 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1BP29016 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD1BP29016 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD1BP29016 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1BP29016 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1BP29016 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD1BP29016 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1BP29016 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD1BP29016 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1BP29016 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD1BP29016 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1BP29016 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD1BP29016 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1BP29016 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1BP29016 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1BP29016 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD1BP29016 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD1BP29016 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD1BP29016 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD1BP29016 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD1BP29016 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1BP29016 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD1BP29016 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1BP29016 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD1BP29016 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD1BP29016 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD1BP29016 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1BP29016 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD1BP29016 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD1BP29016 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD1BP29016 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1BP29016 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD1BP29016 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1BP29016 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1BP29016 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1BP29016 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD1BP29016 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD1BP29016 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD1BP29016 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1BP29016 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD1BP29016 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1BP29016 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD1BP29016 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1BP29016 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD1BP29016 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1BP29016 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD1BP29016 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD1BP29016 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1BP29016 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1BP29016 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD1BP29016 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD1BP29016 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD1BP29016 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD1BP29016 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD1BP29016 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD1BP29016 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1BP29016 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1BP29016 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD1BP29016 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1BP29016 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD1BP29016 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms