Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMA3P25788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMA3P25788 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMA3P25788 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMA3P25788 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMA3P25788 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMA3P25788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA3P25788 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA3P25788 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMA3P25788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMA3P25788 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA3P25788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMA3P25788 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMA3P25788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMA3P25788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMA3P25788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMA3P25788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMA3P25788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMA3P25788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSMA3P25788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMA3P25788 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMA3P25788 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA3P25788 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMA3P25788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMA3P25788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMA3P25788 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMA3P25788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMA3P25788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms