Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSMA3P25788 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSMA3P25788 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PSMA3P25788 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PSMA3P25788 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSMA3P25788 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSMA3P25788 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSMA3P25788 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSMA3P25788 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSMA3P25788 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSMA3P25788 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSMA3P25788 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSMA3P25788 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSMA3P25788 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSMA3P25788 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSMA3P25788 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMA3P25788 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSMA3P25788 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSMA3P25788 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSMA3P25788 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMA3P25788 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSMA3P25788 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSMA3P25788 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSMA3P25788 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSMA3P25788 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSMA3P25788 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PSMA3P25788 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PSMA3P25788 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PSMA3P25788 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSMA3P25788 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSMA3P25788 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSMA3P25788 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSMA3P25788 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMA3P25788 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSMA3P25788 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMA3P25788 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMA3P25788 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSMA3P25788 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMA3P25788 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSMA3P25788 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSMA3P25788 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSMA3P25788 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSMA3P25788 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA3P25788 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA3P25788 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMA3P25788 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMA3P25788 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSMA3P25788 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMA3P25788 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA3P25788 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA3P25788 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMA3P25788 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMA3P25788 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMA3P25788 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMA3P25788 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PSMA3P25788 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMA3P25788 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMA3P25788 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMA3P25788 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMA3P25788 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMA3P25788 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMA3P25788 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMA3P25788 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMA3P25788 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMA3P25788 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMA3P25788 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMA3P25788 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA3P25788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMA3P25788 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMA3P25788 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA3P25788 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA3P25788 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMA3P25788 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMA3P25788 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMA3P25788 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMA3P25788 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMA3P25788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMA3P25788 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMA3P25788 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMA3P25788 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMA3P25788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMA3P25788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMA3P25788 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA3P25788 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMA3P25788 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMA3P25788 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMA3P25788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMA3P25788 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSMA3P25788 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMA3P25788 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMA3P25788 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMA3P25788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMA3P25788 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMA3P25788 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMA3P25788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMA3P25788 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMA3P25788 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMA3P25788 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMA3P25788 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMA3P25788 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms