Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELEP16581 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELEP16581 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELEP16581 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELEP16581 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELEP16581 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELEP16581 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELEP16581 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELEP16581 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SELEP16581 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SELEP16581 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SELEP16581 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SELEP16581 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELEP16581 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELEP16581 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SELEP16581 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELEP16581 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELEP16581 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SELEP16581 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELEP16581 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SELEP16581 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELEP16581 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SELEP16581 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SELEP16581 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SELEP16581 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELEP16581 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SELEP16581 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELEP16581 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SELEP16581 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELEP16581 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SELEP16581 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELEP16581 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SELEP16581 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SELEP16581 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SELEP16581 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SELEP16581 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SELEP16581 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELEP16581 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELEP16581 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELEP16581 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELEP16581 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELEP16581 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELEP16581 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELEP16581 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELEP16581 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELEP16581 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELEP16581 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELEP16581 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELEP16581 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELEP16581 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELEP16581 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELEP16581 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELEP16581 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELEP16581 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SELEP16581 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELEP16581 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SELEP16581 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELEP16581 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELEP16581 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SELEP16581 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELEP16581 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELEP16581 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELEP16581 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELEP16581 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SELEP16581 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELEP16581 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELEP16581 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SELEP16581 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SELEP16581 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELEP16581 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELEP16581 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SELEP16581 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELEP16581 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELEP16581 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELEP16581 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELEP16581 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELEP16581 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELEP16581 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELEP16581 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELEP16581 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELEP16581 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SELEP16581 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SELEP16581 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELEP16581 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SELEP16581 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELEP16581 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELEP16581 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELEP16581 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELEP16581 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELEP16581 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELEP16581 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELEP16581 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELEP16581 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELEP16581 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELEP16581 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELEP16581 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELEP16581 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELEP16581 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELEP16581 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELEP16581 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms