Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2C1P13056 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2C1P13056 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2C1P13056 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2C1P13056 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2C1P13056 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2C1P13056 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2C1P13056 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR2C1P13056 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms