Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NR2C1P13056 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NR2C1P13056 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NR2C1P13056 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NR2C1P13056 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR2C1P13056 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2C1P13056 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NR2C1P13056 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2C1P13056 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR2C1P13056 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2C1P13056 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR2C1P13056 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NR2C1P13056 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2C1P13056 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR2C1P13056 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR2C1P13056 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2C1P13056 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR2C1P13056 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NR2C1P13056 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR2C1P13056 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR2C1P13056 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR2C1P13056 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR2C1P13056 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NR2C1P13056 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2C1P13056 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2C1P13056 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2C1P13056 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2C1P13056 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR2C1P13056 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2C1P13056 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2C1P13056 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR2C1P13056 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR2C1P13056 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR2C1P13056 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR2C1P13056 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2C1P13056 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2C1P13056 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR2C1P13056 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR2C1P13056 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR2C1P13056 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2C1P13056 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR2C1P13056 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR2C1P13056 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2C1P13056 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2C1P13056 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2C1P13056 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2C1P13056 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR2C1P13056 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2C1P13056 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2C1P13056 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2C1P13056 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2C1P13056 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C1P13056 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2C1P13056 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C1P13056 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C1P13056 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2C1P13056 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2C1P13056 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2C1P13056 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2C1P13056 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2C1P13056 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2C1P13056 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2C1P13056 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2C1P13056 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR2C1P13056 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR2C1P13056 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR2C1P13056 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR2C1P13056 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR2C1P13056 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR2C1P13056 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR2C1P13056 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2C1P13056 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NR2C1P13056 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2C1P13056 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2C1P13056 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2C1P13056 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2C1P13056 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2C1P13056 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2C1P13056 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR2C1P13056 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR2C1P13056 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR2C1P13056 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR2C1P13056 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR2C1P13056 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR2C1P13056 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR2C1P13056 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR2C1P13056 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2C1P13056 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2C1P13056 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms