Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBSLP0DN79 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBSLP0DN79 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBSLP0DN79 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CBSLP0DN79 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBSLP0DN79 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CBSLP0DN79 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBSLP0DN79 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBSLP0DN79 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBSLP0DN79 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CBSLP0DN79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBSLP0DN79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBSLP0DN79 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBSLP0DN79 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms