Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HLA-DQB2P05538 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HLA-DQB2P05538 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HLA-DQB2P05538 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HLA-DQB2P05538 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HLA-DQB2P05538 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HLA-DQB2P05538 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLA-DQB2P05538 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLA-DQB2P05538 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HLA-DQB2P05538 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DQB2P05538 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HLA-DQB2P05538 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DQB2P05538 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DQB2P05538 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DQB2P05538 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DQB2P05538 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DQB2P05538 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DQB2P05538 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DQB2P05538 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DQB2P05538 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DQB2P05538 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DQB2P05538 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DQB2P05538 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DQB2P05538 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms