Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR3DP05423 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR3DP05423 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLR3DP05423 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
POLR3DP05423 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR3DP05423 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR3DP05423 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR3DP05423 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR3DP05423 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR3DP05423 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR3DP05423 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3DP05423 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR3DP05423 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
POLR3DP05423 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
POLR3DP05423 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POLR3DP05423 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLR3DP05423 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLR3DP05423 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLR3DP05423 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR3DP05423 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLR3DP05423 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLR3DP05423 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR3DP05423 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLR3DP05423 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR3DP05423 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
POLR3DP05423 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
POLR3DP05423 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR3DP05423 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR3DP05423 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms