Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
POLR3DP05423 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
POLR3DP05423 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLR3DP05423 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLR3DP05423 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
POLR3DP05423 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
POLR3DP05423 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
POLR3DP05423 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
POLR3DP05423 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
POLR3DP05423 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
POLR3DP05423 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLR3DP05423 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
POLR3DP05423 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
POLR3DP05423 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
POLR3DP05423 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR3DP05423 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
POLR3DP05423 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
POLR3DP05423 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
POLR3DP05423 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR3DP05423 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLR3DP05423 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
POLR3DP05423 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR3DP05423 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
POLR3DP05423 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLR3DP05423 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
POLR3DP05423 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
POLR3DP05423 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
POLR3DP05423 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
POLR3DP05423 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
POLR3DP05423 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
POLR3DP05423 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
POLR3DP05423 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
POLR3DP05423 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
POLR3DP05423 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
POLR3DP05423 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
POLR3DP05423 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
POLR3DP05423 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
POLR3DP05423 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLR3DP05423 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
POLR3DP05423 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
POLR3DP05423 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
POLR3DP05423 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
POLR3DP05423 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
POLR3DP05423 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
POLR3DP05423 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
POLR3DP05423 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
POLR3DP05423 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
POLR3DP05423 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
POLR3DP05423 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
POLR3DP05423 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
POLR3DP05423 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR3DP05423 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR3DP05423 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR3DP05423 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR3DP05423 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
POLR3DP05423 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR3DP05423 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR3DP05423 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR3DP05423 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
POLR3DP05423 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR3DP05423 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR3DP05423 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLR3DP05423 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR3DP05423 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
POLR3DP05423 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR3DP05423 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
POLR3DP05423 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLR3DP05423 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR3DP05423 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3DP05423 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3DP05423 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR3DP05423 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR3DP05423 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLR3DP05423 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLR3DP05423 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR3DP05423 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR3DP05423 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3DP05423 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3DP05423 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR3DP05423 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
POLR3DP05423 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR3DP05423 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR3DP05423 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR3DP05423 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR3DP05423 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3DP05423 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLR3DP05423 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR3DP05423 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms