Protein–RNA interactions for Protein: A1L170

C1orf226, Uncharacterized protein C1orf226, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf226A1L170 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C1orf226A1L170 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf226A1L170 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf226A1L170 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf226A1L170 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf226A1L170 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf226A1L170 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf226A1L170 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf226A1L170 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf226A1L170 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf226A1L170 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms