Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms