RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC22-201ENST00000376227 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC22-201ENST00000376227 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.4■■□□□ 1.82
CCDC22-201ENST00000376227 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CCDC22-201ENST00000376227 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CCDC22-201ENST00000376227 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.6■■□□□ 1.69
CCDC22-201ENST00000376227 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC22-201ENST00000376227 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC22-201ENST00000376227 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC22-201ENST00000376227 HRCP23327 699 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC22-201ENST00000376227 ABCC9O60706 1549 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC22-201ENST00000376227 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC22-201ENST00000376227 SCRIBQ14160 1630 aa24.64■■□□□ 1.53
CCDC22-201ENST00000376227 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCDC22-201ENST00000376227 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.58■■□□□ 1.53
CCDC22-201ENST00000376227 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC22-201ENST00000376227 NACADO15069 1562 aa24.39■■□□□ 1.49
CCDC22-201ENST00000376227 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC22-201ENST00000376227 TRIM41Q8WV44 630 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC22-201ENST00000376227 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCDC22-201ENST00000376227 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC22-201ENST00000376227 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC22-201ENST00000376227 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CCDC22-201ENST00000376227 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CCDC22-201ENST00000376227 WIZO95785 1651 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC22-201ENST00000376227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CCDC22-201ENST00000376227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CCDC22-201ENST00000376227 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC22-201ENST00000376227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CCDC22-201ENST00000376227 SMARCA4P51532 1647 aa23.61■■□□□ 1.37
CCDC22-201ENST00000376227 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC22-201ENST00000376227 SMARCA2P51531 1590 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC22-201ENST00000376227 ABCC8Q09428 1581 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC22-201ENST00000376227 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC22-201ENST00000376227 EEA1Q15075 1411 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC22-201ENST00000376227 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CCDC22-201ENST00000376227 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.32■■□□□ 1.32
CCDC22-201ENST00000376227 CEP162Q5TB80 1403 aa23.31■■□□□ 1.32
CCDC22-201ENST00000376227 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CCDC22-201ENST00000376227 SOGA1O94964 1423 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC22-201ENST00000376227 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC22-201ENST00000376227 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCDC22-201ENST00000376227 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC22-201ENST00000376227 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.17■■□□□ 1.3
CCDC22-201ENST00000376227 GOLGA3Q08378 1498 aa23.17■■□□□ 1.3
CCDC22-201ENST00000376227 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCDC22-201ENST00000376227 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
CCDC22-201ENST00000376227 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC22-201ENST00000376227 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC22-201ENST00000376227 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CCDC22-201ENST00000376227 KIF21BO75037 1637 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC22-201ENST00000376227 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC22-201ENST00000376227 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC22-201ENST00000376227 SYNJ1O43426 1573 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC22-201ENST00000376227 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC22-201ENST00000376227 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC22-201ENST00000376227 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC22-201ENST00000376227 CLIP1P30622 1438 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC22-201ENST00000376227 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC22-201ENST00000376227 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC22-201ENST00000376227 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCDC22-201ENST00000376227 APLP2Q06481 763 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC22-201ENST00000376227 TOP2BQ02880 1626 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCDC22-201ENST00000376227 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC22-201ENST00000376227 NEUROD1Q13562 356 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC22-201ENST00000376227 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CCDC22-201ENST00000376227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC22-201ENST00000376227 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC22-201ENST00000376227 HMGXB3Q12766 1538 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC22-201ENST00000376227 PRXQ9BXM0 1461 aa22.55■■□□□ 1.2
CCDC22-201ENST00000376227 NCAPD3P42695 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC22-201ENST00000376227 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CCDC22-201ENST00000376227 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.5■■□□□ 1.19
CCDC22-201ENST00000376227 KIF27Q86VH2 1401 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC22-201ENST00000376227 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC22-201ENST00000376227 ARAP1Q96P48 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
CCDC22-201ENST00000376227 CUX1P39880 1505 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC22-201ENST00000376227 CFTRP13569 1480 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC22-201ENST00000376227 MIER1Q8N108 512 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC22-201ENST00000376227 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC22-201ENST00000376227 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCDC22-201ENST00000376227 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC22-201ENST00000376227 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC22-201ENST00000376227 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC22-201ENST00000376227 CUX2O14529 1486 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC22-201ENST00000376227 PRDM2Q13029 1718 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC22-201ENST00000376227 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC22-201ENST00000376227 IGF1RP08069 1367 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC22-201ENST00000376227 MAP3K1Q13233 1512 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC22-201ENST00000376227 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC22-201ENST00000376227 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC22-201ENST00000376227 TIAM1Q13009 1591 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC22-201ENST00000376227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC22-201ENST00000376227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 ITGAEP38570 1179 aa21.98■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC22-201ENST00000376227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms