RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535710.1

VWCE-205, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VWCE, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-205ENST00000535710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.84■■■■□ 3.17
VWCE-205ENST00000535710 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.84■■■□□ 2.53
VWCE-205ENST00000535710 ABCC9O60706 1549 aa30.68■■■□□ 2.5
VWCE-205ENST00000535710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.42■■■□□ 2.3
VWCE-205ENST00000535710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.2■■■□□ 2.27
VWCE-205ENST00000535710 NACADO15069 1562 aa29.13■■■□□ 2.25
VWCE-205ENST00000535710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.95■■■□□ 2.23
VWCE-205ENST00000535710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
VWCE-205ENST00000535710 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.85■■■□□ 2.21
VWCE-205ENST00000535710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.21e-8■□□□□ 10
VWCE-205ENST00000535710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.69■■■□□ 2.18
VWCE-205ENST00000535710 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.56■■■□□ 2.16
VWCE-205ENST00000535710 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.47■■■□□ 2.15
VWCE-205ENST00000535710 SCRIBQ14160 1630 aa28.34■■■□□ 2.13
VWCE-205ENST00000535710 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.9■■■□□ 2.06
VWCE-205ENST00000535710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
VWCE-205ENST00000535710 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.64■■■□□ 2.02
VWCE-205ENST00000535710 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.53■■■□□ 2
VWCE-205ENST00000535710 SMARCA4P51532 1647 aa27.02■■□□□ 1.92
VWCE-205ENST00000535710 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.01■■□□□ 1.91
VWCE-205ENST00000535710 NCAPD3P42695 1498 aa26.98■■□□□ 1.91
VWCE-205ENST00000535710 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.92■■□□□ 1.9
VWCE-205ENST00000535710 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
VWCE-205ENST00000535710 SMARCA2P51531 1590 aa26.83■■□□□ 1.89
VWCE-205ENST00000535710 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.76■■□□□ 1.87
VWCE-205ENST00000535710 HMGXB3Q12766 1538 aa26.72■■□□□ 1.87
VWCE-205ENST00000535710 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
VWCE-205ENST00000535710 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.71■■□□□ 1.87
VWCE-205ENST00000535710 WIZO95785 1651 aa26.58■■□□□ 1.85
VWCE-205ENST00000535710 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
VWCE-205ENST00000535710 NESP48681 1621 aa26.52■■□□□ 1.84
VWCE-205ENST00000535710 ERCC6Q03468 1493 aa26.36■■□□□ 1.81
VWCE-205ENST00000535710 CUX2O14529 1486 aa26.35■■□□□ 1.81
VWCE-205ENST00000535710 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.23■■□□□ 1.79
VWCE-205ENST00000535710 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
VWCE-205ENST00000535710 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.19■■□□□ 1.78
VWCE-205ENST00000535710 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.1■■□□□ 1.77
VWCE-205ENST00000535710 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.03■■□□□ 1.76
VWCE-205ENST00000535710 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.02■■□□□ 1.76
VWCE-205ENST00000535710 CFTRP13569 1480 aa25.99■■□□□ 1.75
VWCE-205ENST00000535710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
VWCE-205ENST00000535710 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.91■■□□□ 1.74
VWCE-205ENST00000535710 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
VWCE-205ENST00000535710 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.85■■□□□ 1.73
VWCE-205ENST00000535710 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
VWCE-205ENST00000535710 WDR62O43379 1518 aa25.74■■□□□ 1.71
VWCE-205ENST00000535710 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
VWCE-205ENST00000535710 PRDM2Q13029 1718 aa25.54■■□□□ 1.68
VWCE-205ENST00000535710 TRIM41Q8WV44 630 aa25.47■■□□□ 1.67
VWCE-205ENST00000535710 TOPBP1Q92547 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
VWCE-205ENST00000535710 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VWCE-205ENST00000535710 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.34■■□□□ 1.65
VWCE-205ENST00000535710 ABCC8Q09428 1581 aa25.31■■□□□ 1.64
VWCE-205ENST00000535710 IFT140Q96RY7 1462 aa25.31■■□□□ 1.64
VWCE-205ENST00000535710 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VWCE-205ENST00000535710 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.24■■□□□ 1.63
VWCE-205ENST00000535710 CUX1P39880 1505 aa25.24■■□□□ 1.63
VWCE-205ENST00000535710 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.628e-7■■■■■ 28.4
VWCE-205ENST00000535710 SOGA1O94964 1423 aa25.19■■□□□ 1.62
VWCE-205ENST00000535710 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
VWCE-205ENST00000535710 OSCARQ8IYS5 282 aa25.16■■□□□ 1.62
VWCE-205ENST00000535710 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.16■■□□□ 1.62
VWCE-205ENST00000535710 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
VWCE-205ENST00000535710 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
VWCE-205ENST00000535710 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
VWCE-205ENST00000535710 FBLN2P98095 1184 aa24.96■■□□□ 1.59
VWCE-205ENST00000535710 SYNJ1O43426 1573 aa24.95■■□□□ 1.58
VWCE-205ENST00000535710 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.87■■□□□ 1.57
VWCE-205ENST00000535710 TOP2BQ02880 1626 aa24.87■■□□□ 1.57
VWCE-205ENST00000535710 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.87■■□□□ 1.57
VWCE-205ENST00000535710 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.83■■□□□ 1.57
VWCE-205ENST00000535710 WDR97A6NE52 1622 aa24.83■■□□□ 1.57
VWCE-205ENST00000535710 GRIN2BQ13224 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.82■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.82■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.82■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.82■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
VWCE-205ENST00000535710 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.74■■□□□ 1.55
VWCE-205ENST00000535710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VWCE-205ENST00000535710 ARHGEF11O15085 1522 aa24.72■■□□□ 1.55
VWCE-205ENST00000535710 SYNJ2O15056 1496 aa24.69■■□□□ 1.54
VWCE-205ENST00000535710 PBRM1Q86U86 1689 aa24.67■■□□□ 1.54
VWCE-205ENST00000535710 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.61■■□□□ 1.53
VWCE-205ENST00000535710 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.55■■□□□ 1.52
VWCE-205ENST00000535710 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.52■■□□□ 1.52
VWCE-205ENST00000535710 ADAMTS12P58397 1594 aa24.52■■□□□ 1.52
VWCE-205ENST00000535710 GRIN2AQ12879 1464 aa24.52■■□□□ 1.52
VWCE-205ENST00000535710 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.51■■□□□ 1.51
VWCE-205ENST00000535710 IGF1RP08069 1367 aa24.5■■□□□ 1.51
VWCE-205ENST00000535710 ARAP1Q96P48 1450 aa24.48■■□□□ 1.51
VWCE-205ENST00000535710 KIF27Q86VH2 1401 aa24.44■■□□□ 1.5
VWCE-205ENST00000535710 CEP170Q5SW79 1584 aa24.43■■□□□ 1.5
VWCE-205ENST00000535710 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
VWCE-205ENST00000535710 NUP160Q12769 1436 aa24.42■■□□□ 1.5
VWCE-205ENST00000535710 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.36■■□□□ 1.49
VWCE-205ENST00000535710 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.34■■□□□ 1.49
VWCE-205ENST00000535710 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.29■■□□□ 1.48
VWCE-205ENST00000535710 JPH4Q96JJ6 628 aa24.29■■□□□ 1.48
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