RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515774.5

PRIMPOL-211, Transcript of primase and DNA directed polymerase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRIMPOL, Length 2,007 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOL-211ENST00000515774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.15■■■□□ 2.9
PRIMPOL-211ENST00000515774 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.04■■■□□ 2.24
PRIMPOL-211ENST00000515774 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PRIMPOL-211ENST00000515774 ABCC9O60706 1549 aa27.58■■■□□ 2.01
PRIMPOL-211ENST00000515774 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.46■■□□□ 1.99
PRIMPOL-211ENST00000515774 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.41■■□□□ 1.98
PRIMPOL-211ENST00000515774 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
PRIMPOL-211ENST00000515774 NACADO15069 1562 aa27.07■■□□□ 1.92
PRIMPOL-211ENST00000515774 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.92■■□□□ 1.9
PRIMPOL-211ENST00000515774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.89■■□□□ 1.89
PRIMPOL-211ENST00000515774 SCRIBQ14160 1630 aa26.67■■□□□ 1.86
PRIMPOL-211ENST00000515774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.41■■□□□ 1.82
PRIMPOL-211ENST00000515774 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.06■■□□□ 1.76
PRIMPOL-211ENST00000515774 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
PRIMPOL-211ENST00000515774 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PRIMPOL-211ENST00000515774 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.77■■□□□ 1.72
PRIMPOL-211ENST00000515774 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PRIMPOL-211ENST00000515774 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PRIMPOL-211ENST00000515774 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.6■■□□□ 1.69
PRIMPOL-211ENST00000515774 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
PRIMPOL-211ENST00000515774 WIZO95785 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOL-211ENST00000515774 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PRIMPOL-211ENST00000515774 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.22■■□□□ 1.63
PRIMPOL-211ENST00000515774 SMARCA2P51531 1590 aa25.15■■□□□ 1.62
PRIMPOL-211ENST00000515774 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.14■■□□□ 1.62
PRIMPOL-211ENST00000515774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PRIMPOL-211ENST00000515774 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PRIMPOL-211ENST00000515774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.99■■□□□ 1.59
PRIMPOL-211ENST00000515774 NCAPD3P42695 1498 aa24.95■■□□□ 1.58
PRIMPOL-211ENST00000515774 HMGXB3Q12766 1538 aa24.92■■□□□ 1.58
PRIMPOL-211ENST00000515774 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOL-211ENST00000515774 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.6■■□□□ 1.53
PRIMPOL-211ENST00000515774 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.46■■□□□ 1.51
PRIMPOL-211ENST00000515774 CFTRP13569 1480 aa24.35■■□□□ 1.49
PRIMPOL-211ENST00000515774 PRDM2Q13029 1718 aa24.33■■□□□ 1.49
PRIMPOL-211ENST00000515774 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
PRIMPOL-211ENST00000515774 ABCC8Q09428 1581 aa24.29■■□□□ 1.48
PRIMPOL-211ENST00000515774 TRIM41Q8WV44 630 aa24.29■■□□□ 1.48
PRIMPOL-211ENST00000515774 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.17■■□□□ 1.46
PRIMPOL-211ENST00000515774 NESP48681 1621 aa24.16■■□□□ 1.46
PRIMPOL-211ENST00000515774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
PRIMPOL-211ENST00000515774 SYNJ1O43426 1573 aa24.07■■□□□ 1.44
PRIMPOL-211ENST00000515774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.05■■□□□ 1.44
PRIMPOL-211ENST00000515774 TOP2BQ02880 1626 aa23.99■■□□□ 1.43
PRIMPOL-211ENST00000515774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
PRIMPOL-211ENST00000515774 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.97■■□□□ 1.43
PRIMPOL-211ENST00000515774 CUX1P39880 1505 aa23.96■■□□□ 1.43
PRIMPOL-211ENST00000515774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.93■■□□□ 1.42
PRIMPOL-211ENST00000515774 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.92■■□□□ 1.42
PRIMPOL-211ENST00000515774 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PRIMPOL-211ENST00000515774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.82■■□□□ 1.4
PRIMPOL-211ENST00000515774 SOGA1O94964 1423 aa23.78■■□□□ 1.4
PRIMPOL-211ENST00000515774 TOPBP1Q92547 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
PRIMPOL-211ENST00000515774 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PRIMPOL-211ENST00000515774 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.72■■□□□ 1.39
PRIMPOL-211ENST00000515774 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.7■■□□□ 1.39
PRIMPOL-211ENST00000515774 EEA1Q15075 1411 aa23.7■■□□□ 1.38
PRIMPOL-211ENST00000515774 ERCC6Q03468 1493 aa23.69■■□□□ 1.38
PRIMPOL-211ENST00000515774 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.67■■□□□ 1.38
PRIMPOL-211ENST00000515774 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.67■■□□□ 1.38
PRIMPOL-211ENST00000515774 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PRIMPOL-211ENST00000515774 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.59■■□□□ 1.37
PRIMPOL-211ENST00000515774 WDR62O43379 1518 aa23.56■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.56■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 KIF27Q86VH2 1401 aa23.55■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 CUX2O14529 1486 aa23.54■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.52■■□□□ 1.36
PRIMPOL-211ENST00000515774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.51■■□□□ 1.35
PRIMPOL-211ENST00000515774 WDR97A6NE52 1622 aa23.49■■□□□ 1.35
PRIMPOL-211ENST00000515774 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRIMPOL-211ENST00000515774 KIF21BO75037 1637 aa23.43■■□□□ 1.34
PRIMPOL-211ENST00000515774 GOLGA3Q08378 1498 aa23.38■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 IFT140Q96RY7 1462 aa23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 IGF1RP08069 1367 aa23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.35■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 PRXQ9BXM0 1461 aa23.33■■□□□ 1.33
PRIMPOL-211ENST00000515774 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOL-211ENST00000515774 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOL-211ENST00000515774 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOL-211ENST00000515774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOL-211ENST00000515774 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.26■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 PBRM1Q86U86 1689 aa23.24■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.24■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 CUL7Q14999 1698 aa23.24■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOL-211ENST00000515774 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOL-211ENST00000515774 GRIN2BQ13224 1484 aa23.14■■□□□ 1.3
PRIMPOL-211ENST00000515774 CEP162Q5TB80 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
PRIMPOL-211ENST00000515774 ADAMTS12P58397 1594 aa23.06■■□□□ 1.28
PRIMPOL-211ENST00000515774 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.04■■□□□ 1.28
PRIMPOL-211ENST00000515774 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.01■■□□□ 1.27
PRIMPOL-211ENST00000515774 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23■■□□□ 1.27
PRIMPOL-211ENST00000515774 CLIP1P30622 1438 aa22.99■■□□□ 1.27
PRIMPOL-211ENST00000515774 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PRIMPOL-211ENST00000515774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRIMPOL-211ENST00000515774 SYNJ2O15056 1496 aa22.88■■□□□ 1.25
PRIMPOL-211ENST00000515774 GRIN2AQ12879 1464 aa22.86■■□□□ 1.25
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