RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.33■■■□□ 2.45
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PTPRH-201ENST00000263434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRH-201ENST00000263434 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRH-201ENST00000263434 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRH-201ENST00000263434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PTPRH-201ENST00000263434 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRH-201ENST00000263434 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRH-201ENST00000263434 HRCP23327 699 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRH-201ENST00000263434 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRH-201ENST00000263434 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.25■■□□□ 1.63
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PTPRH-201ENST00000263434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRH-201ENST00000263434 TRIM41Q8WV44 630 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRH-201ENST00000263434 SCRIBQ14160 1630 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRH-201ENST00000263434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRH-201ENST00000263434 ABCC9O60706 1549 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRH-201ENST00000263434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.14■■□□□ 1.46
PTPRH-201ENST00000263434 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRH-201ENST00000263434 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRH-201ENST00000263434 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRH-201ENST00000263434 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRH-201ENST00000263434 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRH-201ENST00000263434 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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PTPRH-201ENST00000263434 NEUROD1Q13562 356 aa23.46■■□□□ 1.35
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PTPRH-201ENST00000263434 ABCC8Q09428 1581 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRH-201ENST00000263434 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRH-201ENST00000263434 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRH-201ENST00000263434 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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PTPRH-201ENST00000263434 SOGA1O94964 1423 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRH-201ENST00000263434 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRH-201ENST00000263434 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRH-201ENST00000263434 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRH-201ENST00000263434 CEP162Q5TB80 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRH-201ENST00000263434 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRH-201ENST00000263434 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
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PTPRH-201ENST00000263434 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRH-201ENST00000263434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRH-201ENST00000263434 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRH-201ENST00000263434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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PTPRH-201ENST00000263434 SMARCA2P51531 1590 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRH-201ENST00000263434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
PTPRH-201ENST00000263434 SMARCA4P51532 1647 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRH-201ENST00000263434 GOLGA3Q08378 1498 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRH-201ENST00000263434 CLIP1P30622 1438 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRH-201ENST00000263434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRH-201ENST00000263434 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRH-201ENST00000263434 SYNJ1O43426 1573 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRH-201ENST00000263434 ITGAEP38570 1179 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRH-201ENST00000263434 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRH-201ENST00000263434 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRH-201ENST00000263434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRH-201ENST00000263434 KIF21BO75037 1637 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRH-201ENST00000263434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRH-201ENST00000263434 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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PTPRH-201ENST00000263434 KCNH8Q96L42 1107 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-201ENST00000263434 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-201ENST00000263434 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRH-201ENST00000263434 BCANQ96GW7 911 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRH-201ENST00000263434 P3H3Q8IVL6 736 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRH-201ENST00000263434 TOP2BQ02880 1626 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRH-201ENST00000263434 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PTPRH-201ENST00000263434 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPRH-201ENST00000263434 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRH-201ENST00000263434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRH-201ENST00000263434 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRH-201ENST00000263434 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRH-201ENST00000263434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRH-201ENST00000263434 CUX2O14529 1486 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRH-201ENST00000263434 FKBP8Q14318 412 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRH-201ENST00000263434 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRH-201ENST00000263434 TRIM52Q96A61 297 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRH-201ENST00000263434 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.87■■□□□ 1.09
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