Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.366e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 55.57□□□□□ -1.526e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.596e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.766e-8■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 525.9■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 C1orf122-203ENST00000419397 223 ntTSL 524.52■■□□□ 1.522e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 SDCCAG3-203ENST00000371723 865 ntTSL 224.51■■□□□ 1.512e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)24.15■■□□□ 1.462e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 224.15■■□□□ 1.462e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 323.4■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.312e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.12e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 221.21■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 521.21■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 219.19■□□□□ 0.662e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 218.52■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-210ENST00000565610 507 ntTSL 318.51■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 218.42■□□□□ 0.543e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-213ENST00000566636 863 ntTSL 318.14■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-216ENST00000568709 809 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 516.23■□□□□ 0.192e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 SDCCAG3-206ENST00000446833 459 ntTSL 315.77■□□□□ 0.122e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-206ENST00000563170 904 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-204ENST00000463246 766 ntTSL 315.34■□□□□ 0.053e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-213ENST00000453056 661 ntTSL 314.68□□□□□ -0.062e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 314.59□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-206ENST00000422297 799 ntTSL 312.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 311.92□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LTBR-203ENST00000441074 2327 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.582e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-207ENST00000423785 726 ntTSL 511.37□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 311.1□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NECAB3-206ENST00000477778 462 ntTSL 310.96□□□□□ -0.653e-7■■□□□ 12.6
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PCBP2Q15366 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 210.46□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 210.46□□□□□ -0.732e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RBMS2-207ENST00000552247 1471 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 12.6
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PCBP2Q15366 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-203ENST00000422105 811 ntTSL 58.09□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.162e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-209ENST00000445089 592 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 VPS8-208ENST00000441141 549 ntTSL 44.3□□□□□ -1.722e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 TM9SF4-207ENST00000495749 3023 ntTSL 28.83□□□□□ -11e-15■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 LAMB2-210ENST00000483057 558 ntTSL 214.25□□□□□ -0.135e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 513.08□□□□□ -0.325e-11■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 ANXA6-213ENST00000522664 451 ntTSL 58.52□□□□□ -1.052e-7■■□□□ 12.6
PCBP2Q15366 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 213.44□□□□□ -0.266e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 QKI-211ENST00000540719 588 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-12■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 QKI-213ENST00000544361 613 ntTSL 55.25□□□□□ -1.571e-12■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 511.54□□□□□ -0.566e-8■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-213ENST00000587510 564 ntTSL 46.59□□□□□ -1.356e-8■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SLC26A6-210ENST00000431213 556 ntTSL 410.76□□□□□ -0.697e-8■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.463e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PLEKHH3-203ENST00000587627 1047 ntTSL 521.43■■□□□ 1.023e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RNF11-203ENST00000494873 953 ntTSL 321.32■■□□□ 15e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.86e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-202ENST00000460899 1094 ntTSL 219.97■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-203ENST00000469299 871 ntTSL 319.97■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-204ENST00000470947 796 ntTSL 219.97■□□□□ 0.793e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-205ENST00000490521 562 ntTSL 219.93■□□□□ 0.783e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.777e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.763e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAU2-216ENST00000609122 551 ntTSL 419.25■□□□□ 0.673e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-207ENST00000494596 539 ntTSL 218.22■□□□□ 0.513e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.467e-9■■□□□ 12.5
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