RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491937.5

RPS7-209, Transcript of ribosomal protein S7, humanhuman

TSL 2

Gene RPS7, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS7-209ENST00000491937 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.02■■■■■ 8.16
RPS7-209ENST00000491937 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.26■■■■■ 7.08
RPS7-209ENST00000491937 ABCC9O60706 1549 aa59.25■■■■■ 7.08
RPS7-209ENST00000491937 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.42■■■■■ 6.62
RPS7-209ENST00000491937 NACADO15069 1562 aa56.03■■■■■ 6.56
RPS7-209ENST00000491937 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.72■■■■■ 6.51
RPS7-209ENST00000491937 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.53■■■■■ 6.48
RPS7-209ENST00000491937 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.27■■■■■ 6.44
RPS7-209ENST00000491937 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.15■■■■■ 6.42
RPS7-209ENST00000491937 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.08■■■■■ 6.41
RPS7-209ENST00000491937 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.74■■■■■ 6.35
RPS7-209ENST00000491937 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.73■■■■■ 6.35
RPS7-209ENST00000491937 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.55■■■■■ 6.32
RPS7-209ENST00000491937 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.08■■■■■ 6.25
RPS7-209ENST00000491937 SCRIBQ14160 1630 aa53.99■■■■■ 6.23
RPS7-209ENST00000491937 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.51■■■■■ 6.16
RPS7-209ENST00000491937 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.42■■■■■ 6.14
RPS7-209ENST00000491937 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.39■■■■■ 6.14
RPS7-209ENST00000491937 NCAPD3P42695 1498 aa51.72■■■■■ 5.87
RPS7-209ENST00000491937 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.56■■■■■ 5.84
RPS7-209ENST00000491937 SMARCA4P51532 1647 aa51.51■■■■■ 5.84
RPS7-209ENST00000491937 SMARCA2P51531 1590 aa51.44■■■■■ 5.82
RPS7-209ENST00000491937 HMGXB3Q12766 1538 aa51.35■■■■■ 5.81
RPS7-209ENST00000491937 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.28■■■■■ 5.8
RPS7-209ENST00000491937 ERCC6Q03468 1493 aa51.19■■■■■ 5.79
RPS7-209ENST00000491937 CUX2O14529 1486 aa51.1■■■■■ 5.77
RPS7-209ENST00000491937 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
RPS7-209ENST00000491937 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.03■■■■■ 5.76
RPS7-209ENST00000491937 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.02■■■■■ 5.76
RPS7-209ENST00000491937 NESP48681 1621 aa50.88■■■■■ 5.74
RPS7-209ENST00000491937 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.86■■■■■ 5.73
RPS7-209ENST00000491937 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.56■■■■■ 5.68
RPS7-209ENST00000491937 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
RPS7-209ENST00000491937 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.28■■■■■ 5.64
RPS7-209ENST00000491937 WIZO95785 1651 aa50.24■■■■■ 5.63
RPS7-209ENST00000491937 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.22■■■■■ 5.63
RPS7-209ENST00000491937 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.16■■■■■ 5.62
RPS7-209ENST00000491937 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.85■■■■■ 5.57
RPS7-209ENST00000491937 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
RPS7-209ENST00000491937 WDR62O43379 1518 aa49.72■■■■■ 5.55
RPS7-209ENST00000491937 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.66■■■■■ 5.54
RPS7-209ENST00000491937 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.65■■■■■ 5.54
RPS7-209ENST00000491937 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.59■■■■■ 5.53
RPS7-209ENST00000491937 CFTRP13569 1480 aa49.58■■■■■ 5.53
RPS7-209ENST00000491937 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
RPS7-209ENST00000491937 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.06■■■■■ 5.44
RPS7-209ENST00000491937 PRDM2Q13029 1718 aa49.06■■■■■ 5.44
RPS7-209ENST00000491937 TRIM41Q8WV44 630 aa48.81■■■■■ 5.4
RPS7-209ENST00000491937 OSCARQ8IYS5 282 aa48.75■■■■■ 5.39
RPS7-209ENST00000491937 IFT140Q96RY7 1462 aa48.67■■■■■ 5.38
RPS7-209ENST00000491937 TOPBP1Q92547 1522 aa48.64■■■■■ 5.38
RPS7-209ENST00000491937 ABCC8Q09428 1581 aa48.56■■■■■ 5.36
RPS7-209ENST00000491937 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
RPS7-209ENST00000491937 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.47■■■■■ 5.35
RPS7-209ENST00000491937 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
RPS7-209ENST00000491937 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
RPS7-209ENST00000491937 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
RPS7-209ENST00000491937 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.11■■■■■ 5.293e-8■■■■■ 30.2
RPS7-209ENST00000491937 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.1■■■■■ 5.29
RPS7-209ENST00000491937 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.1■■■■■ 5.29
RPS7-209ENST00000491937 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.1■■■■■ 5.29
RPS7-209ENST00000491937 ARHGEF11O15085 1522 aa47.97■■■■■ 5.27
RPS7-209ENST00000491937 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.96■■■■■ 5.27
RPS7-209ENST00000491937 SOGA1O94964 1423 aa47.93■■■■■ 5.26
RPS7-209ENST00000491937 CHD1O14646 1710 aa47.92■■■■■ 5.26
RPS7-209ENST00000491937 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.85■■■■■ 5.25
RPS7-209ENST00000491937 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
RPS7-209ENST00000491937 FBLN2P98095 1184 aa47.82■■■■■ 5.25
RPS7-209ENST00000491937 CUX1P39880 1505 aa47.8■■■■■ 5.24
RPS7-209ENST00000491937 WDR97A6NE52 1622 aa47.74■■■■■ 5.23
RPS7-209ENST00000491937 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.65■■■■■ 5.22
RPS7-209ENST00000491937 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
RPS7-209ENST00000491937 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.6■■■■■ 5.21
RPS7-209ENST00000491937 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
RPS7-209ENST00000491937 GRIN2BQ13224 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
RPS7-209ENST00000491937 ARAP1Q96P48 1450 aa47.49■■■■■ 5.19
RPS7-209ENST00000491937 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
RPS7-209ENST00000491937 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.4■■■■■ 5.18
RPS7-209ENST00000491937 SYNJ1O43426 1573 aa47.38■■■■■ 5.18
RPS7-209ENST00000491937 SYNJ2O15056 1496 aa47.38■■■■■ 5.17
RPS7-209ENST00000491937 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.35■■■■■ 5.17
RPS7-209ENST00000491937 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.31■■■■■ 5.16
RPS7-209ENST00000491937 PBRM1Q86U86 1689 aa47.31■■■■■ 5.16
RPS7-209ENST00000491937 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.23■■■■■ 5.15
RPS7-209ENST00000491937 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.148e-7■■□□□ 13.9
RPS7-209ENST00000491937 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
RPS7-209ENST00000491937 TOP2BQ02880 1626 aa47.04■■■■■ 5.12
RPS7-209ENST00000491937 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.03■■■■■ 5.12
RPS7-209ENST00000491937 GRIN2AQ12879 1464 aa46.92■■■■■ 5.1
RPS7-209ENST00000491937 ADAMTS12P58397 1594 aa46.89■■■■■ 5.1
RPS7-209ENST00000491937 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.76■■■■■ 5.08
RPS7-209ENST00000491937 NUP160Q12769 1436 aa46.76■■■■■ 5.08
RPS7-209ENST00000491937 CEP170Q5SW79 1584 aa46.73■■■■■ 5.07
RPS7-209ENST00000491937 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.72■■■■■ 5.07
RPS7-209ENST00000491937 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.63■■■■■ 5.06
RPS7-209ENST00000491937 SHROOM2Q13796 1616 aa46.53■■■■■ 5.04
RPS7-209ENST00000491937 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
RPS7-209ENST00000491937 JPH4Q96JJ6 628 aa46.26■■■■■ 5
RPS7-209ENST00000491937 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.23■■■■■ 4.99
RPS7-209ENST00000491937 KIF27Q86VH2 1401 aa46.15■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms