RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460899.5

COMTD1-202, Transcript of catechol-O-methyltransferase domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene COMTD1, Length 1,094 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTD1-202ENST00000460899 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.77■■■■■ 6.36
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COMTD1-202ENST00000460899 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.59■■■■■ 4.73
COMTD1-202ENST00000460899 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.34■■■■■ 4.69
COMTD1-202ENST00000460899 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
COMTD1-202ENST00000460899 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.06■■■■■ 4.64
COMTD1-202ENST00000460899 SMARCA4P51532 1647 aa42.79■■■■■ 4.44
COMTD1-202ENST00000460899 NCAPD3P42695 1498 aa42.73■■■■■ 4.43
COMTD1-202ENST00000460899 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.68■■■■■ 4.42
COMTD1-202ENST00000460899 SMARCA2P51531 1590 aa42.55■■■■■ 4.4
COMTD1-202ENST00000460899 HMGXB3Q12766 1538 aa42.51■■■■■ 4.4
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COMTD1-202ENST00000460899 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.31■■■■■ 4.36
COMTD1-202ENST00000460899 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.28■■■■■ 4.36
COMTD1-202ENST00000460899 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
COMTD1-202ENST00000460899 NESP48681 1621 aa42.2■■■■■ 4.35
COMTD1-202ENST00000460899 ERCC6Q03468 1493 aa42.18■■■■■ 4.34
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COMTD1-202ENST00000460899 WIZO95785 1651 aa41.87■■■■■ 4.29
COMTD1-202ENST00000460899 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.83■■■■■ 4.29
COMTD1-202ENST00000460899 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.82■■■■■ 4.29
COMTD1-202ENST00000460899 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
COMTD1-202ENST00000460899 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.79■■■■■ 4.28
COMTD1-202ENST00000460899 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.43■■■■■ 4.22
COMTD1-202ENST00000460899 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.4■■■■■ 4.22
COMTD1-202ENST00000460899 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
COMTD1-202ENST00000460899 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
COMTD1-202ENST00000460899 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.19■■■■■ 4.18
COMTD1-202ENST00000460899 WDR62O43379 1518 aa41.15■■■■■ 4.18
COMTD1-202ENST00000460899 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.04■■■■■ 4.16
COMTD1-202ENST00000460899 CFTRP13569 1480 aa41.02■■■■■ 4.16
COMTD1-202ENST00000460899 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.02■■■■■ 4.16
COMTD1-202ENST00000460899 PRDM2Q13029 1718 aa40.93■■■■■ 4.14
COMTD1-202ENST00000460899 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
COMTD1-202ENST00000460899 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.72■■■■■ 4.11
COMTD1-202ENST00000460899 TOPBP1Q92547 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
COMTD1-202ENST00000460899 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
COMTD1-202ENST00000460899 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.18■■■■■ 4.02
COMTD1-202ENST00000460899 IFT140Q96RY7 1462 aa40.18■■■■■ 4.02
COMTD1-202ENST00000460899 TRIM41Q8WV44 630 aa40.09■■■■■ 4.01
COMTD1-202ENST00000460899 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
COMTD1-202ENST00000460899 ABCC8Q09428 1581 aa40.05■■■■■ 4
COMTD1-202ENST00000460899 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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COMTD1-202ENST00000460899 CHD1O14646 1710 aa39.88■■■■□ 3.97
COMTD1-202ENST00000460899 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
COMTD1-202ENST00000460899 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
COMTD1-202ENST00000460899 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
COMTD1-202ENST00000460899 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.964e-7■■■■□ 19.7
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COMTD1-202ENST00000460899 CUX1P39880 1505 aa39.72■■■■□ 3.95
COMTD1-202ENST00000460899 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.68■■■■□ 3.94
COMTD1-202ENST00000460899 ARHGEF11O15085 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
COMTD1-202ENST00000460899 SOGA1O94964 1423 aa39.61■■■■□ 3.93
COMTD1-202ENST00000460899 WDR97A6NE52 1622 aa39.58■■■■□ 3.93
COMTD1-202ENST00000460899 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
COMTD1-202ENST00000460899 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
COMTD1-202ENST00000460899 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.45■■■■□ 3.91
COMTD1-202ENST00000460899 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
COMTD1-202ENST00000460899 FBLN2P98095 1184 aa39.38■■■■□ 3.89
COMTD1-202ENST00000460899 ARAP1Q96P48 1450 aa39.28■■■■□ 3.88
COMTD1-202ENST00000460899 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.28■■■■□ 3.88
COMTD1-202ENST00000460899 GRIN2BQ13224 1484 aa39.27■■■■□ 3.88
COMTD1-202ENST00000460899 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
COMTD1-202ENST00000460899 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.26■■■■□ 3.88
COMTD1-202ENST00000460899 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.17■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.17■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 SYNJ1O43426 1573 aa39.16■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.16■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 SYNJ2O15056 1496 aa39.14■■■■□ 3.86
COMTD1-202ENST00000460899 TOP2BQ02880 1626 aa39.09■■■■□ 3.85
COMTD1-202ENST00000460899 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
COMTD1-202ENST00000460899 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.96■■■■□ 3.83
COMTD1-202ENST00000460899 ADAMTS12P58397 1594 aa38.94■■■■□ 3.82
COMTD1-202ENST00000460899 GRIN2AQ12879 1464 aa38.83■■■■□ 3.81
COMTD1-202ENST00000460899 CEP170Q5SW79 1584 aa38.81■■■■□ 3.8
COMTD1-202ENST00000460899 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.77■■■■□ 3.8
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COMTD1-202ENST00000460899 NUP160Q12769 1436 aa38.68■■■■□ 3.78
COMTD1-202ENST00000460899 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.64■■■■□ 3.78
COMTD1-202ENST00000460899 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
COMTD1-202ENST00000460899 SHROOM2Q13796 1616 aa38.63■■■■□ 3.77
COMTD1-202ENST00000460899 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.4■■■■□ 3.74
COMTD1-202ENST00000460899 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
COMTD1-202ENST00000460899 CUL7Q14999 1698 aa38.23■■■■□ 3.71
COMTD1-202ENST00000460899 IGF1RP08069 1367 aa38.17■■■■□ 3.7
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