Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ATF1-204ENST00000552487 745 ntTSL 59.85□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 LINC01667-201ENST00000623554 1137 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TOP3B-214ENST00000457270 2956 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ZNF197-201ENST00000334075 2320 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -12e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -12e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 PSMA1-211ENST00000531156 574 ntTSL 48.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 ZNF197-202ENST00000344387 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 27.45□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 56.87□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 NLRP1-214ENST00000577119 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 56.65□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 NLRP1-207ENST00000571307 4050 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 24.21□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 ATF1-203ENST00000551831 970 ntTSL 22.61□□□□□ -1.992e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)2.57□□□□□ -22e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.5□□□□□ -2.012e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 PSMA1-208ENST00000529524 743 ntTSL 32.28□□□□□ -2.042e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.082e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.196e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.212e-6■■■■□ 19.3
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NIPBLQ6KC79 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-9■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-9■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 19.3
NIPBLQ6KC79 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.225e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.245e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 510.56□□□□□ -0.722e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 59.26□□□□□ -0.932e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.192e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 56.09□□□□□ -1.432e-17■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.871e-6■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 MTHFR-216ENST00000641805 2945 nt10.22□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 19.2
NIPBLQ6KC79 MTHFR-212ENST00000641446 2820 nt9.49□□□□□ -0.891e-7■■■□□ 19.2
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