Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.426e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.086e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TECR-213ENST00000598408 508 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-11■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TECR-206ENST00000594958 601 ntTSL 39.97□□□□□ -0.811e-11■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.267e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TLK1-209ENST00000470340 521 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-237ENST00000601853 749 ntTSL 514.06□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-213ENST00000595380 616 ntTSL 510.15□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-215ENST00000595817 778 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-226ENST00000599040 555 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-228ENST00000600032 810 ntTSL 58.51□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-217ENST00000596467 799 ntTSL 57.77□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FARP1-220ENST00000596613 856 ntTSL 57.69□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.95□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 319.09■□□□□ 0.651e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.316e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-217ENST00000522859 769 ntTSL 212.55□□□□□ -0.46e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-212ENST00000520924 553 ntTSL 47.59□□□□□ -1.196e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SATB2-204ENST00000440919 2166 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.373e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ALG13-210ENST00000471924 711 ntTSL 313.15□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TRAF4-211ENST00000478021 718 ntTSL 321.4■■□□□ 1.027e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADGRG6-214ENST00000545477 657 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-206ENST00000574110 2495 ntTSL 1 (best)23.88■■□□□ 1.411e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-209ENST00000574666 844 ntTSL 522.42■■□□□ 1.181e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-208ENST00000574233 486 ntTSL 37.81□□□□□ -1.161e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.351e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-204ENST00000570704 559 ntTSL 43.83□□□□□ -1.81e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 URI1-212ENST00000576442 578 ntTSL 43.66□□□□□ -1.821e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.582e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SIK3-202ENST00000413553 3054 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.093e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.773e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 NEK8-202ENST00000543014 2055 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.662e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 318.77■□□□□ 0.63e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ZNF76-209ENST00000486891 1654 ntTSL 218.44■□□□□ 0.542e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TSG101-203ENST00000535077 685 ntTSL 318.34■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PRR14-201ENST00000287463 2124 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 317.12■□□□□ 0.333e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-83■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-83■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-83■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-83■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-83■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 415.52■□□□□ 0.083e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCNT2-204ENST00000419781 5414 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.072e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 EPAS1-203ENST00000460015 558 ntTSL 413.82□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PRR14-209ENST00000567322 1059 ntTSL 213.08□□□□□ -0.322e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.484e-14■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.582e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-272ENST00000641991 1360 nt11.3□□□□□ -0.63e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.652e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCNT2-208ENST00000452839 2363 ntTSL 210.96□□□□□ -0.652e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 410.88□□□□□ -0.672e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 NEK8-201ENST00000268766 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-247ENST00000641642 1107 nt10.02□□□□□ -0.813e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SYNJ2-202ENST00000367112 5091 ntTSL 29.98□□□□□ -0.813e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCDC97-202ENST00000596882 413 ntTSL 39.65□□□□□ -0.863e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC9.63□□□□□ -0.873e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SRPRA-207ENST00000532268 829 ntTSL 29.23□□□□□ -0.933e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-263ENST00000641880 1404 nt9.21□□□□□ -0.943e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-235ENST00000641496 1154 nt8.98□□□□□ -0.973e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-254ENST00000641719 1443 nt8.93□□□□□ -0.983e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 14.5
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