Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 ADSL-219ENST00000636433 1444 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 APEH-212ENST00000469362 830 ntTSL 312.35□□□□□ -0.432e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 PLAGL1-203ENST00000367571 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ACTR10-205ENST00000554642 687 ntTSL 38.82□□□□□ -12e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-216ENST00000625194 1079 ntTSL 58.51□□□□□ -1.052e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-213ENST00000624027 732 ntTSL 38.37□□□□□ -1.072e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 THOC1-208ENST00000580038 2033 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-207ENST00000498234 323 ntTSL 27.11□□□□□ -1.272e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.292e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 ADSL-203ENST00000423176 728 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-8■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.42e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-8■□□□□ 9.9
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PABPC4Q13310 PPP4C-204ENST00000562664 941 ntTSL 328.99■■■□□ 2.232e-6■□□□□ 9.9
PABPC4Q13310 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 9.8
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PABPC4Q13310 COPS6-207ENST00000472107 835 ntTSL 222.58■■□□□ 1.215e-7■□□□□ 9.8
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PABPC4Q13310 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.363e-34■□□□□ 9.8
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PABPC4Q13310 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 224.34■■□□□ 1.492e-6■□□□□ 9.8
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PABPC4Q13310 PPOX-211ENST00000494216 892 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 CCNC-202ENST00000369217 674 ntTSL 516.38■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SP3-202ENST00000416195 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 CCNC-211ENST00000521017 579 ntTSL 412.99□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 CCNC-205ENST00000484049 1412 ntTSL 512.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-210ENST00000488564 4020 ntTSL 511.02□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TMOD3-211ENST00000561438 1139 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TMOD3-208ENST00000560725 544 ntTSL 48.19□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.242e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-208ENST00000457186 1174 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-209ENST00000460059 527 ntTSL 36.24□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 46.05□□□□□ -1.442e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 55.58□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TMOD3-207ENST00000560549 1474 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 9.8
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