RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-204ENST00000562664 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.73■■■■■ 7.15
PPP4C-204ENST00000562664 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.71■■■■■ 6.19
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC9O60706 1549 aa53.49■■■■■ 6.15
PPP4C-204ENST00000562664 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.01■■■■■ 5.76
PPP4C-204ENST00000562664 NACADO15069 1562 aa50.67■■■■■ 5.7
PPP4C-204ENST00000562664 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.11■■■■■ 5.61
PPP4C-204ENST00000562664 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.08■■■■■ 5.61
PPP4C-204ENST00000562664 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.02■■■■■ 5.6
PPP4C-204ENST00000562664 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.01■■■■■ 5.6
PPP4C-204ENST00000562664 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.69■■■■■ 5.55
PPP4C-204ENST00000562664 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.58■■■■■ 5.53
PPP4C-204ENST00000562664 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
PPP4C-204ENST00000562664 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.39■■■■■ 5.5
PPP4C-204ENST00000562664 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.9■■■■■ 5.42
PPP4C-204ENST00000562664 SCRIBQ14160 1630 aa48.85■■■■■ 5.41
PPP4C-204ENST00000562664 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.41■■■■■ 5.34
PPP4C-204ENST00000562664 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.32■■■■■ 5.33
PPP4C-204ENST00000562664 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.18■■■■■ 5.3
PPP4C-204ENST00000562664 NCAPD3P42695 1498 aa46.72■■■■■ 5.07
PPP4C-204ENST00000562664 SMARCA4P51532 1647 aa46.65■■■■■ 5.06
PPP4C-204ENST00000562664 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.6■■■■■ 5.05
PPP4C-204ENST00000562664 SMARCA2P51531 1590 aa46.5■■■■■ 5.03
PPP4C-204ENST00000562664 HMGXB3Q12766 1538 aa46.47■■■■■ 5.03
PPP4C-204ENST00000562664 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.01
PPP4C-204ENST00000562664 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.22■■■■■ 4.99
PPP4C-204ENST00000562664 ERCC6Q03468 1493 aa46.15■■■■■ 4.98
PPP4C-204ENST00000562664 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
PPP4C-204ENST00000562664 CUX2O14529 1486 aa46.13■■■■■ 4.98
PPP4C-204ENST00000562664 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.02■■■■■ 4.96
PPP4C-204ENST00000562664 NESP48681 1621 aa45.99■■■■■ 4.95
PPP4C-204ENST00000562664 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.94■■■■■ 4.94
PPP4C-204ENST00000562664 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.73■■■■■ 4.91
PPP4C-204ENST00000562664 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
PPP4C-204ENST00000562664 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.53■■■■■ 4.88
PPP4C-204ENST00000562664 WIZO95785 1651 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4C-204ENST00000562664 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.35■■■■■ 4.85
PPP4C-204ENST00000562664 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.26■■■■■ 4.84
PPP4C-204ENST00000562664 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.03■■■■■ 4.8
PPP4C-204ENST00000562664 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
PPP4C-204ENST00000562664 WDR62O43379 1518 aa44.98■■■■■ 4.79
PPP4C-204ENST00000562664 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
PPP4C-204ENST00000562664 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
PPP4C-204ENST00000562664 CFTRP13569 1480 aa44.81■■■■■ 4.76
PPP4C-204ENST00000562664 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.78■■■■■ 4.76
PPP4C-204ENST00000562664 PRDM2Q13029 1718 aa44.58■■■■■ 4.73
PPP4C-204ENST00000562664 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
PPP4C-204ENST00000562664 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.35■■■■■ 4.69
PPP4C-204ENST00000562664 TOPBP1Q92547 1522 aa43.98■■■■■ 4.63
PPP4C-204ENST00000562664 IFT140Q96RY7 1462 aa43.94■■■■■ 4.62
PPP4C-204ENST00000562664 TRIM41Q8WV44 630 aa43.88■■■■■ 4.62
PPP4C-204ENST00000562664 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
PPP4C-204ENST00000562664 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP4C-204ENST00000562664 OSCARQ8IYS5 282 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC8Q09428 1581 aa43.84■■■■■ 4.61
PPP4C-204ENST00000562664 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
PPP4C-204ENST00000562664 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
PPP4C-204ENST00000562664 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
PPP4C-204ENST00000562664 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP4C-204ENST00000562664 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP4C-204ENST00000562664 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP4C-204ENST00000562664 CHD1O14646 1710 aa43.44■■■■■ 4.54
PPP4C-204ENST00000562664 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.546e-7■■■■□ 24.5
PPP4C-204ENST00000562664 ARHGEF11O15085 1522 aa43.34■■■■■ 4.53
PPP4C-204ENST00000562664 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.32■■■■■ 4.53
PPP4C-204ENST00000562664 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.25■■■■■ 4.51
PPP4C-204ENST00000562664 CUX1P39880 1505 aa43.25■■■■■ 4.51
PPP4C-204ENST00000562664 SOGA1O94964 1423 aa43.24■■■■■ 4.51
PPP4C-204ENST00000562664 WDR97A6NE52 1622 aa43.22■■■■■ 4.51
PPP4C-204ENST00000562664 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
PPP4C-204ENST00000562664 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.05■■■■■ 4.48
PPP4C-204ENST00000562664 FBLN2P98095 1184 aa43■■■■■ 4.47
PPP4C-204ENST00000562664 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.47
PPP4C-204ENST00000562664 GRIN2BQ13224 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
PPP4C-204ENST00000562664 ARAP1Q96P48 1450 aa42.92■■■■■ 4.46
PPP4C-204ENST00000562664 PBRM1Q86U86 1689 aa42.92■■■■■ 4.46
PPP4C-204ENST00000562664 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.9■■■■■ 4.46
PPP4C-204ENST00000562664 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
PPP4C-204ENST00000562664 SYNJ1O43426 1573 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP4C-204ENST00000562664 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP4C-204ENST00000562664 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.8■■■■■ 4.44
PPP4C-204ENST00000562664 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP4C-204ENST00000562664 SYNJ2O15056 1496 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP4C-204ENST00000562664 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.76■■■■■ 4.44
PPP4C-204ENST00000562664 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
PPP4C-204ENST00000562664 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.65■■■■■ 4.42
PPP4C-204ENST00000562664 TOP2BQ02880 1626 aa42.6■■■■■ 4.41
PPP4C-204ENST00000562664 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.53■■■■■ 4.4
PPP4C-204ENST00000562664 ADAMTS12P58397 1594 aa42.46■■■■■ 4.39
PPP4C-204ENST00000562664 GRIN2AQ12879 1464 aa42.4■■■■■ 4.38
PPP4C-204ENST00000562664 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PPP4C-204ENST00000562664 CEP170Q5SW79 1584 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP4C-204ENST00000562664 NUP160Q12769 1436 aa42.26■■■■■ 4.36
PPP4C-204ENST00000562664 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP4C-204ENST00000562664 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.21■■■■■ 4.35
PPP4C-204ENST00000562664 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.21■■■■■ 4.35
PPP4C-204ENST00000562664 SHROOM2Q13796 1616 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP4C-204ENST00000562664 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.88■■■■■ 4.29
PPP4C-204ENST00000562664 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
PPP4C-204ENST00000562664 CUL7Q14999 1698 aa41.7■■■■■ 4.27
PPP4C-204ENST00000562664 JPH4Q96JJ6 628 aa41.67■■■■■ 4.26
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