RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416970.5

SNHG7-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG7, Length 789 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG7-202ENST00000416970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.4■■■■■ 6.62
SNHG7-202ENST00000416970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.91■■■■■ 5.58
SNHG7-202ENST00000416970 ABCC9O60706 1549 aa48.2■■■■■ 5.31
SNHG7-202ENST00000416970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
SNHG7-202ENST00000416970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.92■■■■■ 5.1
SNHG7-202ENST00000416970 NACADO15069 1562 aa46.86■■■■■ 5.09
SNHG7-202ENST00000416970 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.83■■■■■ 5.09
SNHG7-202ENST00000416970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.79■■■■■ 5.08
SNHG7-202ENST00000416970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.75■■■■■ 5.07
SNHG7-202ENST00000416970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.46■■■■■ 4.87
SNHG7-202ENST00000416970 SCRIBQ14160 1630 aa45.44■■■■■ 4.87
SNHG7-202ENST00000416970 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.16■■■■■ 4.82
SNHG7-202ENST00000416970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
SNHG7-202ENST00000416970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.01■■■■■ 4.8
SNHG7-202ENST00000416970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
SNHG7-202ENST00000416970 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
SNHG7-202ENST00000416970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
SNHG7-202ENST00000416970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.69■■■■■ 4.58
SNHG7-202ENST00000416970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.65■■■■■ 4.58
SNHG7-202ENST00000416970 SMARCA4P51532 1647 aa43.59■■■■■ 4.57
SNHG7-202ENST00000416970 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.38■■■■■ 4.54
SNHG7-202ENST00000416970 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.52
SNHG7-202ENST00000416970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.27■■■■■ 4.52
SNHG7-202ENST00000416970 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.24■■■■■ 4.51
SNHG7-202ENST00000416970 NCAPD3P42695 1498 aa43.23■■■■■ 4.51
SNHG7-202ENST00000416970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
SNHG7-202ENST00000416970 HMGXB3Q12766 1538 aa43.04■■■■■ 4.48
SNHG7-202ENST00000416970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SNHG7-202ENST00000416970 WIZO95785 1651 aa42.91■■■■■ 4.46
SNHG7-202ENST00000416970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
SNHG7-202ENST00000416970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
SNHG7-202ENST00000416970 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
SNHG7-202ENST00000416970 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.01■■■■■ 4.31
SNHG7-202ENST00000416970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.98■■■■■ 4.31
SNHG7-202ENST00000416970 CFTRP13569 1480 aa41.84■■■■■ 4.29
SNHG7-202ENST00000416970 NESP48681 1621 aa41.82■■■■■ 4.29
SNHG7-202ENST00000416970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
SNHG7-202ENST00000416970 ERCC6Q03468 1493 aa41.61■■■■■ 4.25
SNHG7-202ENST00000416970 PRDM2Q13029 1718 aa41.48■■■■■ 4.23
SNHG7-202ENST00000416970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.46■■■■■ 4.23
SNHG7-202ENST00000416970 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.37■■■■■ 4.21
SNHG7-202ENST00000416970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.33■■■■■ 4.21
SNHG7-202ENST00000416970 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.2■■■■■ 4.19
SNHG7-202ENST00000416970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SNHG7-202ENST00000416970 ABCC8Q09428 1581 aa41.06■■■■■ 4.16
SNHG7-202ENST00000416970 CUX2O14529 1486 aa41.03■■■■■ 4.16
SNHG7-202ENST00000416970 WDR62O43379 1518 aa41.01■■■■■ 4.16
SNHG7-202ENST00000416970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SNHG7-202ENST00000416970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.86■■■■■ 4.13
SNHG7-202ENST00000416970 TOPBP1Q92547 1522 aa40.83■■■■■ 4.13
SNHG7-202ENST00000416970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
SNHG7-202ENST00000416970 CUX1P39880 1505 aa40.67■■■■■ 4.1
SNHG7-202ENST00000416970 TOP2BQ02880 1626 aa40.54■■■■■ 4.08
SNHG7-202ENST00000416970 IFT140Q96RY7 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
SNHG7-202ENST00000416970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
SNHG7-202ENST00000416970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
SNHG7-202ENST00000416970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
SNHG7-202ENST00000416970 SYNJ1O43426 1573 aa40.45■■■■■ 4.07
SNHG7-202ENST00000416970 SOGA1O94964 1423 aa40.44■■■■■ 4.06
SNHG7-202ENST00000416970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
SNHG7-202ENST00000416970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.28■■■■■ 4.04
SNHG7-202ENST00000416970 TRIM41Q8WV44 630 aa40.22■■■■■ 4.03
SNHG7-202ENST00000416970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.2■■■■■ 4.03
SNHG7-202ENST00000416970 WDR97A6NE52 1622 aa40.2■■■■■ 4.03
SNHG7-202ENST00000416970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
SNHG7-202ENST00000416970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
SNHG7-202ENST00000416970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.03■■■■■ 43e-8■■■■■ 31.4
SNHG7-202ENST00000416970 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.01■■■■■ 4
SNHG7-202ENST00000416970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
SNHG7-202ENST00000416970 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.96■■■■□ 3.99
SNHG7-202ENST00000416970 GRIN2BQ13224 1484 aa39.91■■■■□ 3.98
SNHG7-202ENST00000416970 KIF27Q86VH2 1401 aa39.9■■■■□ 3.98
SNHG7-202ENST00000416970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.89■■■■□ 3.98
SNHG7-202ENST00000416970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.75■■■■□ 3.95
SNHG7-202ENST00000416970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
SNHG7-202ENST00000416970 PBRM1Q86U86 1689 aa39.72■■■■□ 3.95
SNHG7-202ENST00000416970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.68■■■■□ 3.94
SNHG7-202ENST00000416970 IGF1RP08069 1367 aa39.61■■■■□ 3.93
SNHG7-202ENST00000416970 EEA1Q15075 1411 aa39.58■■■■□ 3.93
SNHG7-202ENST00000416970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
SNHG7-202ENST00000416970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
SNHG7-202ENST00000416970 SYNJ2O15056 1496 aa39.56■■■■□ 3.92
SNHG7-202ENST00000416970 FBLN2P98095 1184 aa39.52■■■■□ 3.92
SNHG7-202ENST00000416970 OSCARQ8IYS5 282 aa39.49■■■■□ 3.91
SNHG7-202ENST00000416970 ADAMTS12P58397 1594 aa39.47■■■■□ 3.91
SNHG7-202ENST00000416970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.47■■■■□ 3.91
SNHG7-202ENST00000416970 CUL7Q14999 1698 aa39.47■■■■□ 3.91
SNHG7-202ENST00000416970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.43■■■■□ 3.9
SNHG7-202ENST00000416970 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.39■■■■□ 3.9
SNHG7-202ENST00000416970 CHD1O14646 1710 aa39.37■■■■□ 3.89
SNHG7-202ENST00000416970 GRIN2AQ12879 1464 aa39.34■■■■□ 3.89
SNHG7-202ENST00000416970 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.24■■■■□ 3.87
SNHG7-202ENST00000416970 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
SNHG7-202ENST00000416970 PRXQ9BXM0 1461 aa39.19■■■■□ 3.86
SNHG7-202ENST00000416970 NUP160Q12769 1436 aa39.16■■■■□ 3.86
SNHG7-202ENST00000416970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.11■■■■□ 3.85
SNHG7-202ENST00000416970 CEP170Q5SW79 1584 aa39.03■■■■□ 3.84
SNHG7-202ENST00000416970 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
SNHG7-202ENST00000416970 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.98■■■■□ 3.83
SNHG7-202ENST00000416970 KIF21BO75037 1637 aa38.96■■■■□ 3.83
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