RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TMOD3-211ENST00000561438 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.06■■□□□ 1.28
TMOD3-211ENST00000561438 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMOD3-211ENST00000561438 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.03■□□□□ 0.8
TMOD3-211ENST00000561438 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
TMOD3-211ENST00000561438 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.92■□□□□ 0.62
TMOD3-211ENST00000561438 FOXD1Q16676 465 aa18.21■□□□□ 0.51
TMOD3-211ENST00000561438 ADRA2BP18089 450 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD3-211ENST00000561438 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.78■□□□□ 0.44
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.74■□□□□ 0.43
TMOD3-211ENST00000561438 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TMOD3-211ENST00000561438 ABCC9O60706 1549 aa16.98■□□□□ 0.31
TMOD3-211ENST00000561438 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TMOD3-211ENST00000561438 MSH5O43196 834 aa16.7■□□□□ 0.26
TMOD3-211ENST00000561438 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.69■□□□□ 0.26
TMOD3-211ENST00000561438 KCNA4P22459 653 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD3-211ENST00000561438 POTEDQ86YR6 584 aa16.57■□□□□ 0.24
TMOD3-211ENST00000561438 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD3-211ENST00000561438 NACADO15069 1562 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD3-211ENST00000561438 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.45■□□□□ 0.22
TMOD3-211ENST00000561438 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.43■□□□□ 0.22
TMOD3-211ENST00000561438 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.43■□□□□ 0.22
TMOD3-211ENST00000561438 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TMOD3-211ENST00000561438 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TMOD3-211ENST00000561438 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.36■□□□□ 0.21
TMOD3-211ENST00000561438 SCRIBQ14160 1630 aa16.24■□□□□ 0.19
TMOD3-211ENST00000561438 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-211ENST00000561438 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-211ENST00000561438 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-211ENST00000561438 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-211ENST00000561438 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-211ENST00000561438 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMOD3-211ENST00000561438 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.92■□□□□ 0.14
TMOD3-211ENST00000561438 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
TMOD3-211ENST00000561438 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.77■□□□□ 0.12
TMOD3-211ENST00000561438 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TMOD3-211ENST00000561438 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD3-211ENST00000561438 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD3-211ENST00000561438 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TMOD3-211ENST00000561438 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.56■□□□□ 0.08
TMOD3-211ENST00000561438 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TMOD3-211ENST00000561438 SMARCA4P51532 1647 aa15.55■□□□□ 0.08
TMOD3-211ENST00000561438 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.52■□□□□ 0.07
TMOD3-211ENST00000561438 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD3-211ENST00000561438 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD3-211ENST00000561438 WIZO95785 1651 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD3-211ENST00000561438 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TMOD3-211ENST00000561438 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.36■□□□□ 0.05
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB22O15209 634 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD3-211ENST00000561438 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD3-211ENST00000561438 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.28■□□□□ 0.04
TMOD3-211ENST00000561438 SMARCA2P51531 1590 aa15.24■□□□□ 0.03
TMOD3-211ENST00000561438 HMGXB3Q12766 1538 aa15.2■□□□□ 0.02
TMOD3-211ENST00000561438 NCAPD3P42695 1498 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD3-211ENST00000561438 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD3-211ENST00000561438 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TMOD3-211ENST00000561438 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.1■□□□□ 0.01
TMOD3-211ENST00000561438 SLC4A2P04920 1241 aa15.1■□□□□ 0.01
TMOD3-211ENST00000561438 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.97□□□□□ -0.01
TMOD3-211ENST00000561438 PRDM2Q13029 1718 aa14.92□□□□□ -0.02
TMOD3-211ENST00000561438 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TMOD3-211ENST00000561438 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
TMOD3-211ENST00000561438 NESP48681 1621 aa14.88□□□□□ -0.03
TMOD3-211ENST00000561438 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.82□□□□□ -0.04
TMOD3-211ENST00000561438 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.77□□□□□ -0.04
TMOD3-211ENST00000561438 CFTRP13569 1480 aa14.76□□□□□ -0.05
TMOD3-211ENST00000561438 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.74□□□□□ -0.05
TMOD3-211ENST00000561438 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.7□□□□□ -0.06
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD3-211ENST00000561438 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMOD3-211ENST00000561438 ABCC8Q09428 1581 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD3-211ENST00000561438 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMOD3-211ENST00000561438 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.61□□□□□ -0.07
TMOD3-211ENST00000561438 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMOD3-211ENST00000561438 SYNJ1O43426 1573 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD3-211ENST00000561438 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TMOD3-211ENST00000561438 CUX1P39880 1505 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD3-211ENST00000561438 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD3-211ENST00000561438 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.52□□□□□ -0.08
TMOD3-211ENST00000561438 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.5□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 WDR62O43379 1518 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 ERCC6Q03468 1493 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 TOP2BQ02880 1626 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD3-211ENST00000561438 TOPBP1Q92547 1522 aa14.46□□□□□ -0.1
TMOD3-211ENST00000561438 APLP2Q06481 763 aa14.44□□□□□ -0.1
TMOD3-211ENST00000561438 WDR97A6NE52 1622 aa14.44□□□□□ -0.1
TMOD3-211ENST00000561438 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
TMOD3-211ENST00000561438 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
TMOD3-211ENST00000561438 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TMOD3-211ENST00000561438 CUX2O14529 1486 aa14.38□□□□□ -0.11
TMOD3-211ENST00000561438 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.37□□□□□ -0.11
TMOD3-211ENST00000561438 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TMOD3-211ENST00000561438 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD3-211ENST00000561438 RNF39Q9H2S5 420 aa14.31□□□□□ -0.12
TMOD3-211ENST00000561438 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD3-211ENST00000561438 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.1 ms