Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.445e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-208ENST00000466354 630 ntTSL 323.42■■□□□ 1.345e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.255e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CMAS-203ENST00000535610 854 ntTSL 522.52■■□□□ 1.22e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.142e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.135e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-205ENST00000532513 1028 ntTSL 522.07■■□□□ 1.124e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TOMM22-202ENST00000492561 782 ntTSL 221.92■■□□□ 1.16e-13■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CDC37-208ENST00000590632 601 ntTSL 221.72■■□□□ 1.075e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HGS-216ENST00000576498 1004 ntTSL 221.67■■□□□ 1.065e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-202ENST00000377612 580 ntTSL 521.59■■□□□ 1.055e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.925e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.95e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-206ENST00000533664 1007 ntTSL 219.83■□□□□ 0.774e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LEPROTL1-206ENST00000520682 580 ntTSL 519.14■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CDC37-204ENST00000589331 537 ntTSL 219.11■□□□□ 0.655e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.645e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CHCHD5-205ENST00000489052 554 ntTSL 318.9■□□□□ 0.625e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.585e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-209ENST00000477377 533 ntTSL 318.67■□□□□ 0.585e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HGS-208ENST00000572392 824 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 518.42■□□□□ 0.545e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CDC37-205ENST00000589625 587 ntTSL 217.98■□□□□ 0.475e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-208ENST00000471682 447 ntTSL 317.97■□□□□ 0.475e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.45e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-216ENST00000603309 923 ntTSL 217.52■□□□□ 0.45e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.394e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 317.1■□□□□ 0.336e-13■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-207ENST00000464050 790 ntTSL 316.33■□□□□ 0.25e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.055e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-214ENST00000603187 3713 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.15e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.125e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.135e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-202ENST00000412198 3611 ntTSL 213.54□□□□□ -0.245e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LEPROTL1-208ENST00000523116 1389 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-206ENST00000460675 463 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-222ENST00000604754 3369 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.375e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZSWIM8-209ENST00000466568 466 ntTSL 212.64□□□□□ -0.395e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-212ENST00000497707 392 ntTSL 512.43□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 MYO18A-201ENST00000527312 573 ntTSL 212.37□□□□□ -0.435e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PRPF38A-202ENST00000474048 1059 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.525e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.825e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 IPO5-208ENST00000469360 3505 ntTSL 29.68□□□□□ -0.866e-19■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 29.08□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ALG5-204ENST00000486410 565 ntTSL 28.29□□□□□ -1.085e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.195e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 27.39□□□□□ -1.235e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CMAS-204ENST00000537658 590 ntTSL 37.25□□□□□ -1.252e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 GPN3-209ENST00000551079 833 ntTSL 36.89□□□□□ -1.315e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 26.61□□□□□ -1.355e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.425e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-210ENST00000483290 595 ntTSL 26.01□□□□□ -1.455e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LEPROTL1-207ENST00000520739 559 ntTSL 45.97□□□□□ -1.455e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ACOT13-202ENST00000476436 733 ntTSL 35.42□□□□□ -1.545e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.695e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.85e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.845e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-211ENST00000486516 374 ntTSL 53.03□□□□□ -1.925e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.995e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-14■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.021e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.471e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 314.22□□□□□ -0.135e-10■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.079e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.089e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 214.54□□□□□ -0.089e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.139e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.319e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.369e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 212.55□□□□□ -0.49e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.439e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 512.32□□□□□ -0.449e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.499e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.629e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 211□□□□□ -0.659e-62■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-62■□□□□ 10
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 342.6 ms