RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.02■■■■□ 3.2
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.78■■■□□ 2.52
EFTUD2-214ENST00000589769 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
EFTUD2-214ENST00000589769 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.11■■■□□ 2.25
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCC9O60706 1549 aa28.87■■■□□ 2.21
EFTUD2-214ENST00000589769 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.84■■■□□ 2.21
EFTUD2-214ENST00000589769 NACADO15069 1562 aa28.58■■■□□ 2.17
EFTUD2-214ENST00000589769 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.46■■■□□ 2.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.34■■■□□ 2.13
EFTUD2-214ENST00000589769 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.16■■■□□ 2.1
EFTUD2-214ENST00000589769 SCRIBQ14160 1630 aa28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-214ENST00000589769 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.81■■■□□ 2.04
EFTUD2-214ENST00000589769 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
EFTUD2-214ENST00000589769 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.12■■□□□ 1.93
EFTUD2-214ENST00000589769 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
EFTUD2-214ENST00000589769 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
EFTUD2-214ENST00000589769 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.928e-8■□□□□ 11.2
EFTUD2-214ENST00000589769 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.01■■□□□ 1.91
EFTUD2-214ENST00000589769 SMARCA4P51532 1647 aa26.99■■□□□ 1.91
EFTUD2-214ENST00000589769 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
EFTUD2-214ENST00000589769 WIZO95785 1651 aa26.78■■□□□ 1.88
EFTUD2-214ENST00000589769 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.76■■□□□ 1.87
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
EFTUD2-214ENST00000589769 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
EFTUD2-214ENST00000589769 SMARCA2P51531 1590 aa26.55■■□□□ 1.84
EFTUD2-214ENST00000589769 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.5■■□□□ 1.83
EFTUD2-214ENST00000589769 HMGXB3Q12766 1538 aa26.39■■□□□ 1.82
EFTUD2-214ENST00000589769 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
EFTUD2-214ENST00000589769 NCAPD3P42695 1498 aa26.31■■□□□ 1.8
EFTUD2-214ENST00000589769 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.25■■□□□ 1.79
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.19■■□□□ 1.78
EFTUD2-214ENST00000589769 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.89■■□□□ 1.74
EFTUD2-214ENST00000589769 PRDM2Q13029 1718 aa25.75■■□□□ 1.71
EFTUD2-214ENST00000589769 CFTRP13569 1480 aa25.71■■□□□ 1.71
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCC8Q09428 1581 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-214ENST00000589769 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-214ENST00000589769 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.5■■□□□ 1.67
EFTUD2-214ENST00000589769 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM41Q8WV44 630 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-214ENST00000589769 SYNJ1O43426 1573 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-214ENST00000589769 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.42■■□□□ 1.66
EFTUD2-214ENST00000589769 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.4■■□□□ 1.66
EFTUD2-214ENST00000589769 TOP2BQ02880 1626 aa25.39■■□□□ 1.66
EFTUD2-214ENST00000589769 NESP48681 1621 aa25.33■■□□□ 1.65
EFTUD2-214ENST00000589769 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.3■■□□□ 1.64
EFTUD2-214ENST00000589769 CUX1P39880 1505 aa25.28■■□□□ 1.64
EFTUD2-214ENST00000589769 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.19■■□□□ 1.62
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.18■■□□□ 1.62
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.17■■□□□ 1.62
EFTUD2-214ENST00000589769 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.16■■□□□ 1.62
EFTUD2-214ENST00000589769 EEA1Q15075 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
EFTUD2-214ENST00000589769 TOPBP1Q92547 1522 aa25.06■■□□□ 1.6
EFTUD2-214ENST00000589769 SOGA1O94964 1423 aa25.03■■□□□ 1.6
EFTUD2-214ENST00000589769 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
EFTUD2-214ENST00000589769 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25■■□□□ 1.59
EFTUD2-214ENST00000589769 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.94■■□□□ 1.58
EFTUD2-214ENST00000589769 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.94■■□□□ 1.58
EFTUD2-214ENST00000589769 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR97A6NE52 1622 aa24.9■■□□□ 1.58
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR62O43379 1518 aa24.88■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF21BO75037 1637 aa24.87■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.85■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 KIF27Q86VH2 1401 aa24.83■■□□□ 1.57
EFTUD2-214ENST00000589769 ERCC6Q03468 1493 aa24.77■■□□□ 1.56
EFTUD2-214ENST00000589769 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.77■■□□□ 1.56
EFTUD2-214ENST00000589769 CUX2O14529 1486 aa24.77■■□□□ 1.56
EFTUD2-214ENST00000589769 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.74■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 GOLGA3Q08378 1498 aa24.73■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.73■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.72■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.72■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 PRXQ9BXM0 1461 aa24.7■■□□□ 1.55
EFTUD2-214ENST00000589769 IFT140Q96RY7 1462 aa24.61■■□□□ 1.53
EFTUD2-214ENST00000589769 CUL7Q14999 1698 aa24.6■■□□□ 1.53
EFTUD2-214ENST00000589769 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.58■■□□□ 1.53
EFTUD2-214ENST00000589769 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.58■■□□□ 1.53
EFTUD2-214ENST00000589769 IGF1RP08069 1367 aa24.56■■□□□ 1.52
EFTUD2-214ENST00000589769 PBRM1Q86U86 1689 aa24.53■■□□□ 1.52
EFTUD2-214ENST00000589769 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.51■■□□□ 1.51
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP162Q5TB80 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.42■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ADAMTS12P58397 1594 aa24.4■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
EFTUD2-214ENST00000589769 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.38■■□□□ 1.49
EFTUD2-214ENST00000589769 GRIN2BQ13224 1484 aa24.38■■□□□ 1.49
EFTUD2-214ENST00000589769 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 23.2
EFTUD2-214ENST00000589769 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
EFTUD2-214ENST00000589769 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.31■■□□□ 1.48
EFTUD2-214ENST00000589769 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.28■■□□□ 1.48
EFTUD2-214ENST00000589769 CLIP1P30622 1438 aa24.26■■□□□ 1.47
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-214ENST00000589769 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.21■■□□□ 1.47
EFTUD2-214ENST00000589769 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-214ENST00000589769 ARAP1Q96P48 1450 aa24.12■■□□□ 1.45
EFTUD2-214ENST00000589769 SYNJ2O15056 1496 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms