Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.657e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.767e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.767e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 510.1□□□□□ -0.797e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.947e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.93□□□□□ -1.147e-40■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.023e-6■□□□□ 10.1
UTP18Q9Y5J1 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.135e-10■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.395e-10■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 PHF19-207ENST00000456291 888 ntTSL 324.42■■□□□ 1.59e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.319e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.659e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.519e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.489e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.329e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 216.35■□□□□ 0.219e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.19e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 212.82□□□□□ -0.369e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 511.87□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 411.72□□□□□ -0.539e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 511.34□□□□□ -0.599e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.669e-7■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-20■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-20■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.97□□□□□ -1.451e-20■□□□□ 10
UTP18Q9Y5J1 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 420.74■□□□□ 0.912e-20■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 47.37□□□□□ -1.232e-20■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-20■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.154e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 221.52■■□□□ 1.044e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 521.01■□□□□ 0.954e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.744e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 416.81■□□□□ 0.284e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 416.73■□□□□ 0.274e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.264e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 416.21■□□□□ 0.194e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 311.52□□□□□ -0.574e-16■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.826e-14■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.346e-14■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.086e-14■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.293e-7■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 519.76■□□□□ 0.753e-7■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 219.2■□□□□ 0.663e-7■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.463e-7■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 FAM193B-213ENST00000510429 839 ntTSL 317.67■□□□□ 0.423e-7■□□□□ 9.9
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.077e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-205ENST00000578574 958 ntTSL 224.99■■□□□ 1.597e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-220ENST00000584781 562 ntTSL 423.62■■□□□ 1.377e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.187e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-208ENST00000579572 863 ntTSL 320.97■□□□□ 0.957e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-206ENST00000578684 866 ntTSL 319.78■□□□□ 0.767e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-217ENST00000583237 808 ntTSL 319.37■□□□□ 0.697e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-212ENST00000581642 557 ntTSL 419.15■□□□□ 0.667e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-219ENST00000584689 1033 ntTSL 218.86■□□□□ 0.617e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-203ENST00000577650 545 ntTSL 317.23■□□□□ 0.357e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 515.68■□□□□ 0.17e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.78□□□□□ -0.368e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.488e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.58e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 510.58□□□□□ -0.728e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.06□□□□□ -0.968e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.39□□□□□ -1.078e-11■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 320.1■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 218.12■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-207ENST00000593096 728 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 KRT19-206ENST00000479031 427 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 CTNNB1-212ENST00000471014 607 ntTSL 313.26□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 423.09■■□□□ 1.294e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 422.87■■□□□ 1.254e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 422.2■■□□□ 1.144e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 322.03■■□□□ 1.124e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)21.93■■□□□ 1.14e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 220.15■□□□□ 0.826e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 419.4■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 218.73■□□□□ 0.596e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.444e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 517.4■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 516.98■□□□□ 0.316e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 316.43■□□□□ 0.226e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 514.57□□□□□ -0.086e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.256e-7■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC8.69□□□□□ -1.024e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 SMG1P1-201ENST00000308347 1058 ntTSL 57.35□□□□□ -1.234e-6■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 56.26□□□□□ -1.411e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FKTN-206ENST00000479846 317 ntTSL 55□□□□□ -1.619e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.699e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.739e-8■□□□□ 9.8
UTP18Q9Y5J1 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 34.14□□□□□ -1.751e-8■□□□□ 9.8
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