Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXO1Q9UQ84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXO1Q9UQ84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms