RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.33■■■■■ 6.45
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.8■■■■■ 5.4
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC9O60706 1549 aa46.75■■■■■ 5.08
TCEA1-211ENST00000522635 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
TCEA1-211ENST00000522635 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.84■■■■■ 4.93
TCEA1-211ENST00000522635 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.69■■■■■ 4.9
TCEA1-211ENST00000522635 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.67■■■■■ 4.9
TCEA1-211ENST00000522635 NACADO15069 1562 aa45.6■■■■■ 4.89
TCEA1-211ENST00000522635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.41■■■■■ 4.86
TCEA1-211ENST00000522635 SCRIBQ14160 1630 aa44.6■■■■■ 4.73
TCEA1-211ENST00000522635 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.45■■■■■ 4.71
TCEA1-211ENST00000522635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.27■■■■■ 4.68
TCEA1-211ENST00000522635 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.05■■■■■ 4.64
TCEA1-211ENST00000522635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.8■■■■■ 4.6
TCEA1-211ENST00000522635 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.99■■■■■ 4.47
TCEA1-211ENST00000522635 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
TCEA1-211ENST00000522635 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
TCEA1-211ENST00000522635 SMARCA4P51532 1647 aa42.75■■■■■ 4.43
TCEA1-211ENST00000522635 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.67■■■■■ 4.42
TCEA1-211ENST00000522635 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
TCEA1-211ENST00000522635 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.35■■■■■ 4.37
TCEA1-211ENST00000522635 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.33■■■■■ 4.37
TCEA1-211ENST00000522635 WIZO95785 1651 aa42.26■■■■■ 4.36
TCEA1-211ENST00000522635 SMARCA2P51531 1590 aa42.24■■■■■ 4.35
TCEA1-211ENST00000522635 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.24■■■■■ 4.35
TCEA1-211ENST00000522635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
TCEA1-211ENST00000522635 NCAPD3P42695 1498 aa42.05■■■■■ 4.32
TCEA1-211ENST00000522635 HMGXB3Q12766 1538 aa41.99■■■■■ 4.31
TCEA1-211ENST00000522635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.97■■■■■ 4.31
TCEA1-211ENST00000522635 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
TCEA1-211ENST00000522635 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.35■■■■■ 4.21
TCEA1-211ENST00000522635 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.86■■■■■ 4.13
TCEA1-211ENST00000522635 CFTRP13569 1480 aa40.86■■■■■ 4.13
TCEA1-211ENST00000522635 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.81■■■■■ 4.12
TCEA1-211ENST00000522635 NESP48681 1621 aa40.77■■■■■ 4.12
TCEA1-211ENST00000522635 PRDM2Q13029 1718 aa40.68■■■■■ 4.1
TCEA1-211ENST00000522635 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.45■■■■■ 4.07
TCEA1-211ENST00000522635 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.42■■■■■ 4.06
TCEA1-211ENST00000522635 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.35■■■■■ 4.05
TCEA1-211ENST00000522635 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.28■■■■■ 4.04
TCEA1-211ENST00000522635 ERCC6Q03468 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC8Q09428 1581 aa40.18■■■■■ 4.02
TCEA1-211ENST00000522635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
TCEA1-211ENST00000522635 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.03■■■■■ 4
TCEA1-211ENST00000522635 CUX1P39880 1505 aa39.98■■■■□ 3.99
TCEA1-211ENST00000522635 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
TCEA1-211ENST00000522635 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
TCEA1-211ENST00000522635 SYNJ1O43426 1573 aa39.96■■■■□ 3.99
TCEA1-211ENST00000522635 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.95■■■■□ 3.99
TCEA1-211ENST00000522635 TOP2BQ02880 1626 aa39.9■■■■□ 3.98
TCEA1-211ENST00000522635 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.9■■■■□ 3.98
TCEA1-211ENST00000522635 WDR62O43379 1518 aa39.89■■■■□ 3.98
TCEA1-211ENST00000522635 TOPBP1Q92547 1522 aa39.89■■■■□ 3.98
TCEA1-211ENST00000522635 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.89■■■■□ 3.98
TCEA1-211ENST00000522635 TRIM41Q8WV44 630 aa39.71■■■■□ 3.95
TCEA1-211ENST00000522635 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.68■■■■□ 3.94
TCEA1-211ENST00000522635 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-211ENST00000522635 CUX2O14529 1486 aa39.51■■■■□ 3.91
TCEA1-211ENST00000522635 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.43■■■■□ 3.9
TCEA1-211ENST00000522635 SOGA1O94964 1423 aa39.43■■■■□ 3.9
TCEA1-211ENST00000522635 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
TCEA1-211ENST00000522635 IFT140Q96RY7 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
TCEA1-211ENST00000522635 WDR97A6NE52 1622 aa39.36■■■■□ 3.89
TCEA1-211ENST00000522635 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.34■■■■□ 3.89
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
TCEA1-211ENST00000522635 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.14■■■■□ 3.86
TCEA1-211ENST00000522635 KIF27Q86VH2 1401 aa39.13■■■■□ 3.85
TCEA1-211ENST00000522635 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
TCEA1-211ENST00000522635 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.09■■■■□ 3.85
TCEA1-211ENST00000522635 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
TCEA1-211ENST00000522635 EEA1Q15075 1411 aa39.04■■■■□ 3.84
TCEA1-211ENST00000522635 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.02■■■■□ 3.844e-8■■■■□ 23.2
TCEA1-211ENST00000522635 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.02■■■■□ 3.84
TCEA1-211ENST00000522635 PBRM1Q86U86 1689 aa38.93■■■■□ 3.82
TCEA1-211ENST00000522635 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.88■■■■□ 3.82
TCEA1-211ENST00000522635 GRIN2BQ13224 1484 aa38.88■■■■□ 3.81
TCEA1-211ENST00000522635 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
TCEA1-211ENST00000522635 IGF1RP08069 1367 aa38.83■■■■□ 3.81
TCEA1-211ENST00000522635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.78■■■■□ 3.8
TCEA1-211ENST00000522635 CUL7Q14999 1698 aa38.74■■■■□ 3.79
TCEA1-211ENST00000522635 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.72■■■■□ 3.79
TCEA1-211ENST00000522635 ADAMTS12P58397 1594 aa38.7■■■■□ 3.79
TCEA1-211ENST00000522635 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
TCEA1-211ENST00000522635 PRXQ9BXM0 1461 aa38.66■■■■□ 3.78
TCEA1-211ENST00000522635 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.62■■■■□ 3.77
TCEA1-211ENST00000522635 KIF21BO75037 1637 aa38.61■■■■□ 3.77
TCEA1-211ENST00000522635 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.6■■■■□ 3.77
TCEA1-211ENST00000522635 SYNJ2O15056 1496 aa38.52■■■■□ 3.76
TCEA1-211ENST00000522635 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.52■■■■□ 3.76
TCEA1-211ENST00000522635 GOLGA3Q08378 1498 aa38.44■■■■□ 3.74
TCEA1-211ENST00000522635 GRIN2AQ12879 1464 aa38.41■■■■□ 3.74
TCEA1-211ENST00000522635 CHD1O14646 1710 aa38.38■■■■□ 3.74
TCEA1-211ENST00000522635 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
TCEA1-211ENST00000522635 FBLN2P98095 1184 aa38.28■■■■□ 3.72
TCEA1-211ENST00000522635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.28■■■■□ 3.72
TCEA1-211ENST00000522635 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.22■■■■□ 3.71
TCEA1-211ENST00000522635 NUP160Q12769 1436 aa38.2■■■■□ 3.71
TCEA1-211ENST00000522635 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
TCEA1-211ENST00000522635 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms