RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403503.1

YPEL1-202, Transcript of yippee like 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene YPEL1, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL1-202ENST00000403503 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.63■■■■■ 6.66
YPEL1-202ENST00000403503 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.29■■■■■ 5.64
YPEL1-202ENST00000403503 ABCC9O60706 1549 aa48.37■■■■■ 5.33
YPEL1-202ENST00000403503 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
YPEL1-202ENST00000403503 NACADO15069 1562 aa47.07■■■■■ 5.12
YPEL1-202ENST00000403503 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.05■■■■■ 5.12
YPEL1-202ENST00000403503 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.01■■■■■ 5.12
YPEL1-202ENST00000403503 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
YPEL1-202ENST00000403503 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.77■■■■■ 5.08
YPEL1-202ENST00000403503 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.92■■■■■ 4.94
YPEL1-202ENST00000403503 SCRIBQ14160 1630 aa45.73■■■■■ 4.91
YPEL1-202ENST00000403503 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.46■■■■■ 4.87
YPEL1-202ENST00000403503 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.24■■■■■ 4.83
YPEL1-202ENST00000403503 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
YPEL1-202ENST00000403503 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
YPEL1-202ENST00000403503 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.93■■■■■ 4.62
YPEL1-202ENST00000403503 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
YPEL1-202ENST00000403503 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.89■■■■■ 4.62
YPEL1-202ENST00000403503 SMARCA4P51532 1647 aa43.88■■■■■ 4.61
YPEL1-202ENST00000403503 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.73■■■■■ 4.59
YPEL1-202ENST00000403503 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.59■■■■■ 4.57
YPEL1-202ENST00000403503 SMARCA2P51531 1590 aa43.5■■■■■ 4.55
YPEL1-202ENST00000403503 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.5■■■■■ 4.55
YPEL1-202ENST00000403503 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.42■■■■■ 4.54
YPEL1-202ENST00000403503 NCAPD3P42695 1498 aa43.35■■■■■ 4.53
YPEL1-202ENST00000403503 HMGXB3Q12766 1538 aa43.29■■■■■ 4.52
YPEL1-202ENST00000403503 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
YPEL1-202ENST00000403503 WIZO95785 1651 aa43.17■■■■■ 4.5
YPEL1-202ENST00000403503 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
YPEL1-202ENST00000403503 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
YPEL1-202ENST00000403503 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
YPEL1-202ENST00000403503 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.21■■■■■ 4.35
YPEL1-202ENST00000403503 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.2■■■■■ 4.35
YPEL1-202ENST00000403503 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.06■■■■■ 4.32
YPEL1-202ENST00000403503 NESP48681 1621 aa42.02■■■■■ 4.32
YPEL1-202ENST00000403503 CFTRP13569 1480 aa41.98■■■■■ 4.31
YPEL1-202ENST00000403503 PRDM2Q13029 1718 aa41.91■■■■■ 4.3
YPEL1-202ENST00000403503 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.81■■■■■ 4.28
YPEL1-202ENST00000403503 ERCC6Q03468 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
YPEL1-202ENST00000403503 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.68■■■■■ 4.26
YPEL1-202ENST00000403503 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.6■■■■■ 4.25
YPEL1-202ENST00000403503 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
YPEL1-202ENST00000403503 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
YPEL1-202ENST00000403503 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.36■■■■■ 4.21
YPEL1-202ENST00000403503 WDR62O43379 1518 aa41.25■■■■■ 4.19
YPEL1-202ENST00000403503 CUX2O14529 1486 aa41.19■■■■■ 4.18
YPEL1-202ENST00000403503 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
YPEL1-202ENST00000403503 ABCC8Q09428 1581 aa41.12■■■■■ 4.17
YPEL1-202ENST00000403503 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
YPEL1-202ENST00000403503 TOPBP1Q92547 1522 aa41.01■■■■■ 4.16
YPEL1-202ENST00000403503 CUX1P39880 1505 aa40.88■■■■■ 4.14
YPEL1-202ENST00000403503 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
YPEL1-202ENST00000403503 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.8■■■■■ 4.12
YPEL1-202ENST00000403503 TOP2BQ02880 1626 aa40.77■■■■■ 4.12
YPEL1-202ENST00000403503 SYNJ1O43426 1573 aa40.72■■■■■ 4.11
YPEL1-202ENST00000403503 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
YPEL1-202ENST00000403503 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.66■■■■■ 4.1
YPEL1-202ENST00000403503 IFT140Q96RY7 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
YPEL1-202ENST00000403503 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
YPEL1-202ENST00000403503 SOGA1O94964 1423 aa40.48■■■■■ 4.07
YPEL1-202ENST00000403503 WDR97A6NE52 1622 aa40.45■■■■■ 4.07
YPEL1-202ENST00000403503 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.41■■■■■ 4.06
YPEL1-202ENST00000403503 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.36■■■■■ 4.05
YPEL1-202ENST00000403503 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
YPEL1-202ENST00000403503 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
YPEL1-202ENST00000403503 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.2■■■■■ 4.03
YPEL1-202ENST00000403503 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
YPEL1-202ENST00000403503 TRIM41Q8WV44 630 aa40.11■■■■■ 4.01
YPEL1-202ENST00000403503 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
YPEL1-202ENST00000403503 PBRM1Q86U86 1689 aa40.07■■■■■ 4
YPEL1-202ENST00000403503 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.07■■■■■ 4
YPEL1-202ENST00000403503 GRIN2BQ13224 1484 aa40.01■■■■■ 4
YPEL1-202ENST00000403503 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.95■■■■□ 3.99
YPEL1-202ENST00000403503 KIF27Q86VH2 1401 aa39.95■■■■□ 3.99
YPEL1-202ENST00000403503 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
YPEL1-202ENST00000403503 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
YPEL1-202ENST00000403503 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.85■■■■□ 3.97
YPEL1-202ENST00000403503 ADAMTS12P58397 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
YPEL1-202ENST00000403503 CUL7Q14999 1698 aa39.73■■■■□ 3.95
YPEL1-202ENST00000403503 SYNJ2O15056 1496 aa39.7■■■■□ 3.95
YPEL1-202ENST00000403503 CHD1O14646 1710 aa39.7■■■■□ 3.95
YPEL1-202ENST00000403503 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.65■■■■□ 3.94
YPEL1-202ENST00000403503 EEA1Q15075 1411 aa39.65■■■■□ 3.94
YPEL1-202ENST00000403503 IGF1RP08069 1367 aa39.62■■■■□ 3.93
YPEL1-202ENST00000403503 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.6■■■■□ 3.93
YPEL1-202ENST00000403503 GRIN2AQ12879 1464 aa39.51■■■■□ 3.92
YPEL1-202ENST00000403503 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
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YPEL1-202ENST00000403503 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.43■■■■□ 3.9
YPEL1-202ENST00000403503 OSCARQ8IYS5 282 aa39.39■■■■□ 3.9
YPEL1-202ENST00000403503 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.33■■■■□ 3.89
YPEL1-202ENST00000403503 PRXQ9BXM0 1461 aa39.32■■■■□ 3.89
YPEL1-202ENST00000403503 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
YPEL1-202ENST00000403503 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.3■■■■□ 3.88
YPEL1-202ENST00000403503 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.28■■■■□ 3.88
YPEL1-202ENST00000403503 CEP170Q5SW79 1584 aa39.28■■■■□ 3.88
YPEL1-202ENST00000403503 KIF21BO75037 1637 aa39.2■■■■□ 3.87
YPEL1-202ENST00000403503 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
YPEL1-202ENST00000403503 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.07■■■■□ 3.84
YPEL1-202ENST00000403503 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.06■■■■□ 3.84
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