RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481767.5

PFN2-210, Transcript of profilin 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PFN2, Length 1,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2-210ENST00000481767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.26■■■■■ 6.6
PFN2-210ENST00000481767 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.99■■■■■ 5.59
PFN2-210ENST00000481767 ABCC9O60706 1549 aa48.91■■■■■ 5.42
PFN2-210ENST00000481767 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.01■■■■■ 5.12
PFN2-210ENST00000481767 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.01■■■■■ 5.12
PFN2-210ENST00000481767 NACADO15069 1562 aa46.96■■■■■ 5.11
PFN2-210ENST00000481767 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
PFN2-210ENST00000481767 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.67■■■■■ 5.06
PFN2-210ENST00000481767 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.5■■■■■ 5.03
PFN2-210ENST00000481767 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.08■■■■■ 4.97
PFN2-210ENST00000481767 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
PFN2-210ENST00000481767 SCRIBQ14160 1630 aa45.68■■■■■ 4.9
PFN2-210ENST00000481767 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.66■■■■■ 4.9
PFN2-210ENST00000481767 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.05■■■■■ 4.8
PFN2-210ENST00000481767 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.87■■■■■ 4.77
PFN2-210ENST00000481767 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
PFN2-210ENST00000481767 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
PFN2-210ENST00000481767 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.91■■■■■ 4.62
PFN2-210ENST00000481767 SMARCA4P51532 1647 aa43.67■■■■■ 4.58
PFN2-210ENST00000481767 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
PFN2-210ENST00000481767 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.4■■■■■ 4.54
PFN2-210ENST00000481767 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.39■■■■■ 4.54
PFN2-210ENST00000481767 NCAPD3P42695 1498 aa43.34■■■■■ 4.53
PFN2-210ENST00000481767 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.53
PFN2-210ENST00000481767 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
PFN2-210ENST00000481767 HMGXB3Q12766 1538 aa43.14■■■■■ 4.5
PFN2-210ENST00000481767 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
PFN2-210ENST00000481767 WIZO95785 1651 aa42.97■■■■■ 4.47
PFN2-210ENST00000481767 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
PFN2-210ENST00000481767 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
PFN2-210ENST00000481767 NESP48681 1621 aa42.37■■■■■ 4.37
PFN2-210ENST00000481767 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.19■■■■■ 4.35
PFN2-210ENST00000481767 ERCC6Q03468 1493 aa42.11■■■■■ 4.33
PFN2-210ENST00000481767 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.08■■■■■ 4.33
PFN2-210ENST00000481767 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.97■■■■■ 4.31
PFN2-210ENST00000481767 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.88■■■■■ 4.3
PFN2-210ENST00000481767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.88■■■■■ 4.29
PFN2-210ENST00000481767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
PFN2-210ENST00000481767 CFTRP13569 1480 aa41.85■■■■■ 4.29
PFN2-210ENST00000481767 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
PFN2-210ENST00000481767 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.62■■■■■ 4.25
PFN2-210ENST00000481767 CUX2O14529 1486 aa41.62■■■■■ 4.25
PFN2-210ENST00000481767 PRDM2Q13029 1718 aa41.59■■■■■ 4.25
PFN2-210ENST00000481767 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.56■■■■■ 4.24
PFN2-210ENST00000481767 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.47■■■■■ 4.23
PFN2-210ENST00000481767 WDR62O43379 1518 aa41.35■■■■■ 4.21
PFN2-210ENST00000481767 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PFN2-210ENST00000481767 TOPBP1Q92547 1522 aa40.97■■■■■ 4.15
PFN2-210ENST00000481767 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.92■■■■■ 4.14
PFN2-210ENST00000481767 ABCC8Q09428 1581 aa40.9■■■■■ 4.14
PFN2-210ENST00000481767 CUX1P39880 1505 aa40.71■■■■■ 4.11
PFN2-210ENST00000481767 IFT140Q96RY7 1462 aa40.66■■■■■ 4.1
PFN2-210ENST00000481767 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.1
PFN2-210ENST00000481767 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
PFN2-210ENST00000481767 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
PFN2-210ENST00000481767 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.54■■■■■ 4.08
PFN2-210ENST00000481767 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.48■■■■■ 4.07
PFN2-210ENST00000481767 SOGA1O94964 1423 aa40.44■■■■■ 4.06
PFN2-210ENST00000481767 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.06
PFN2-210ENST00000481767 SYNJ1O43426 1573 aa40.38■■■■■ 4.06
PFN2-210ENST00000481767 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
PFN2-210ENST00000481767 TOP2BQ02880 1626 aa40.35■■■■■ 4.05
PFN2-210ENST00000481767 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.35■■■■■ 4.05
PFN2-210ENST00000481767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.045e-12■■■■■ 47.9
PFN2-210ENST00000481767 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.3■■■■■ 4.04
PFN2-210ENST00000481767 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
PFN2-210ENST00000481767 WDR97A6NE52 1622 aa40.24■■■■■ 4.03
PFN2-210ENST00000481767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.13■■■■■ 4.02
PFN2-210ENST00000481767 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40■■■■□ 3.99
PFN2-210ENST00000481767 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
PFN2-210ENST00000481767 GRIN2BQ13224 1484 aa39.95■■■■□ 3.99
PFN2-210ENST00000481767 PBRM1Q86U86 1689 aa39.95■■■■□ 3.99
PFN2-210ENST00000481767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.93■■■■□ 3.98
PFN2-210ENST00000481767 OSCARQ8IYS5 282 aa39.91■■■■□ 3.98
PFN2-210ENST00000481767 CHD1O14646 1710 aa39.89■■■■□ 3.98
PFN2-210ENST00000481767 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PFN2-210ENST00000481767 FBLN2P98095 1184 aa39.8■■■■□ 3.96
PFN2-210ENST00000481767 SYNJ2O15056 1496 aa39.7■■■■□ 3.95
PFN2-210ENST00000481767 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
PFN2-210ENST00000481767 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
PFN2-210ENST00000481767 ADAMTS12P58397 1594 aa39.61■■■■□ 3.93
PFN2-210ENST00000481767 KIF27Q86VH2 1401 aa39.55■■■■□ 3.92
PFN2-210ENST00000481767 TRIM41Q8WV44 630 aa39.51■■■■□ 3.91
PFN2-210ENST00000481767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.5■■■■□ 3.91
PFN2-210ENST00000481767 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.5■■■■□ 3.91
PFN2-210ENST00000481767 GRIN2AQ12879 1464 aa39.47■■■■□ 3.91
PFN2-210ENST00000481767 IGF1RP08069 1367 aa39.42■■■■□ 3.9
PFN2-210ENST00000481767 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.41■■■■□ 3.9
PFN2-210ENST00000481767 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
PFN2-210ENST00000481767 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
PFN2-210ENST00000481767 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
PFN2-210ENST00000481767 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.31■■■■□ 3.88
PFN2-210ENST00000481767 CUL7Q14999 1698 aa39.31■■■■□ 3.88
PFN2-210ENST00000481767 ARHGEF11O15085 1522 aa39.31■■■■□ 3.88
PFN2-210ENST00000481767 CEP170Q5SW79 1584 aa39.3■■■■□ 3.88
PFN2-210ENST00000481767 NUP160Q12769 1436 aa39.27■■■■□ 3.88
PFN2-210ENST00000481767 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.17■■■■□ 3.86
PFN2-210ENST00000481767 ARAP1Q96P48 1450 aa39.01■■■■□ 3.84
PFN2-210ENST00000481767 SHROOM2Q13796 1616 aa39■■■■□ 3.83
PFN2-210ENST00000481767 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms