Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNKSR2Q8WXI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNKSR2Q8WXI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNKSR2Q8WXI2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms