RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538838.5

TMEM260-202, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM260, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-202ENST00000538838 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.63■■■■■ 6.5
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TMEM260-202ENST00000538838 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
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TMEM260-202ENST00000538838 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.02■■■■■ 4.96
TMEM260-202ENST00000538838 NACADO15069 1562 aa45.91■■■■■ 4.94
TMEM260-202ENST00000538838 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.87■■■■■ 4.93
TMEM260-202ENST00000538838 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.78■■■■■ 4.92
TMEM260-202ENST00000538838 SCRIBQ14160 1630 aa44.97■■■■■ 4.79
TMEM260-202ENST00000538838 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.93■■■■■ 4.78
TMEM260-202ENST00000538838 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
TMEM260-202ENST00000538838 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.42■■■■■ 4.7
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TMEM260-202ENST00000538838 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.27■■■■■ 4.52
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TMEM260-202ENST00000538838 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.94■■■■■ 4.46
TMEM260-202ENST00000538838 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.78■■■■■ 4.44
TMEM260-202ENST00000538838 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
TMEM260-202ENST00000538838 WIZO95785 1651 aa42.58■■■■■ 4.41
TMEM260-202ENST00000538838 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.56■■■■■ 4.4
TMEM260-202ENST00000538838 SMARCA2P51531 1590 aa42.51■■■■■ 4.4
TMEM260-202ENST00000538838 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.51■■■■■ 4.4
TMEM260-202ENST00000538838 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.49■■■■■ 4.39
TMEM260-202ENST00000538838 NCAPD3P42695 1498 aa42.31■■■■■ 4.36
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TMEM260-202ENST00000538838 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
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TMEM260-202ENST00000538838 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.58■■■■■ 4.25
TMEM260-202ENST00000538838 NESP48681 1621 aa41.15■■■■■ 4.18
TMEM260-202ENST00000538838 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.13■■■■■ 4.17
TMEM260-202ENST00000538838 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.12■■■■■ 4.17
TMEM260-202ENST00000538838 CFTRP13569 1480 aa41.09■■■■■ 4.17
TMEM260-202ENST00000538838 PRDM2Q13029 1718 aa41.04■■■■■ 4.16
TMEM260-202ENST00000538838 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.77■■■■■ 4.12
TMEM260-202ENST00000538838 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.75■■■■■ 4.11
TMEM260-202ENST00000538838 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.71■■■■■ 4.11
TMEM260-202ENST00000538838 ERCC6Q03468 1493 aa40.61■■■■■ 4.09
TMEM260-202ENST00000538838 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.59■■■■■ 4.09
TMEM260-202ENST00000538838 ABCC8Q09428 1581 aa40.43■■■■■ 4.06
TMEM260-202ENST00000538838 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
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TMEM260-202ENST00000538838 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
TMEM260-202ENST00000538838 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.24■■■■■ 4.03
TMEM260-202ENST00000538838 CUX1P39880 1505 aa40.23■■■■■ 4.03
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TMEM260-202ENST00000538838 WDR62O43379 1518 aa40.21■■■■■ 4.03
TMEM260-202ENST00000538838 SYNJ1O43426 1573 aa40.2■■■■■ 4.03
TMEM260-202ENST00000538838 TOPBP1Q92547 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
TMEM260-202ENST00000538838 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.14■■■■■ 4.02
TMEM260-202ENST00000538838 TOP2BQ02880 1626 aa40.11■■■■■ 4.01
TMEM260-202ENST00000538838 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.94■■■■□ 3.98
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TMEM260-202ENST00000538838 IFT140Q96RY7 1462 aa39.67■■■■□ 3.94
TMEM260-202ENST00000538838 WDR97A6NE52 1622 aa39.66■■■■□ 3.94
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TMEM260-202ENST00000538838 KIF27Q86VH2 1401 aa39.31■■■■□ 3.88
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TMEM260-202ENST00000538838 GRIN2BQ13224 1484 aa39.14■■■■□ 3.86
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TMEM260-202ENST00000538838 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
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TMEM260-202ENST00000538838 ADAMTS12P58397 1594 aa38.97■■■■□ 3.83
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TMEM260-202ENST00000538838 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.83■■■■□ 3.81
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TMEM260-202ENST00000538838 CHD1O14646 1710 aa38.8■■■■□ 3.8
TMEM260-202ENST00000538838 SYNJ2O15056 1496 aa38.79■■■■□ 3.8
TMEM260-202ENST00000538838 PRXQ9BXM0 1461 aa38.79■■■■□ 3.8
TMEM260-202ENST00000538838 KIF21BO75037 1637 aa38.75■■■■□ 3.79
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TMEM260-202ENST00000538838 GRIN2AQ12879 1464 aa38.67■■■■□ 3.78
TMEM260-202ENST00000538838 FBLN2P98095 1184 aa38.65■■■■□ 3.78
TMEM260-202ENST00000538838 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
TMEM260-202ENST00000538838 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.56■■■■□ 3.76
TMEM260-202ENST00000538838 GOLGA3Q08378 1498 aa38.55■■■■□ 3.76
TMEM260-202ENST00000538838 CEP170Q5SW79 1584 aa38.5■■■■□ 3.75
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TMEM260-202ENST00000538838 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.34■■■■□ 3.73
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