RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617539.1

NEDD4L-237, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NEDD4L, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-237ENST00000617539 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.48■■■■■ 6.47
NEDD4L-237ENST00000617539 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.67■■■■■ 5.54
NEDD4L-237ENST00000617539 ABCC9O60706 1549 aa49.26■■■■■ 5.48
NEDD4L-237ENST00000617539 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.04■■■■■ 5.12
NEDD4L-237ENST00000617539 NACADO15069 1562 aa46.81■■■■■ 5.08
NEDD4L-237ENST00000617539 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.5■■■■■ 5.03
NEDD4L-237ENST00000617539 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.31■■■■■ 5
NEDD4L-237ENST00000617539 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.14■■■■■ 4.98
NEDD4L-237ENST00000617539 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
NEDD4L-237ENST00000617539 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.91■■■■■ 4.94
NEDD4L-237ENST00000617539 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.94
NEDD4L-237ENST00000617539 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.86■■■■■ 4.93
NEDD4L-237ENST00000617539 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.76■■■■■ 4.92
NEDD4L-237ENST00000617539 SCRIBQ14160 1630 aa45.27■■■■■ 4.84
NEDD4L-237ENST00000617539 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.09■■■■■ 4.81
NEDD4L-237ENST00000617539 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.56■■■■■ 4.72
NEDD4L-237ENST00000617539 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
NEDD4L-237ENST00000617539 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.32■■■■■ 4.69
NEDD4L-237ENST00000617539 SMARCA4P51532 1647 aa43.23■■■■■ 4.51
NEDD4L-237ENST00000617539 NCAPD3P42695 1498 aa43.21■■■■■ 4.51
NEDD4L-237ENST00000617539 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.14■■■■■ 4.5
NEDD4L-237ENST00000617539 SMARCA2P51531 1590 aa43.03■■■■■ 4.48
NEDD4L-237ENST00000617539 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
NEDD4L-237ENST00000617539 HMGXB3Q12766 1538 aa42.96■■■■■ 4.47
NEDD4L-237ENST00000617539 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.82■■■■■ 4.45
NEDD4L-237ENST00000617539 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.78■■■■■ 4.44
NEDD4L-237ENST00000617539 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
NEDD4L-237ENST00000617539 NESP48681 1621 aa42.46■■■■■ 4.39
NEDD4L-237ENST00000617539 ERCC6Q03468 1493 aa42.44■■■■■ 4.38
NEDD4L-237ENST00000617539 WIZO95785 1651 aa42.31■■■■■ 4.36
NEDD4L-237ENST00000617539 CUX2O14529 1486 aa42.29■■■■■ 4.36
NEDD4L-237ENST00000617539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.19■■■■■ 4.34
NEDD4L-237ENST00000617539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
NEDD4L-237ENST00000617539 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NEDD4L-237ENST00000617539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.97■■■■■ 4.31
NEDD4L-237ENST00000617539 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.88■■■■■ 4.3
NEDD4L-237ENST00000617539 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
NEDD4L-237ENST00000617539 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.81■■■■■ 4.28
NEDD4L-237ENST00000617539 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
NEDD4L-237ENST00000617539 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
NEDD4L-237ENST00000617539 CFTRP13569 1480 aa41.53■■■■■ 4.24
NEDD4L-237ENST00000617539 WDR62O43379 1518 aa41.47■■■■■ 4.23
NEDD4L-237ENST00000617539 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.44■■■■■ 4.22
NEDD4L-237ENST00000617539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.43■■■■■ 4.22
NEDD4L-237ENST00000617539 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.27■■■■■ 4.2
NEDD4L-237ENST00000617539 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
NEDD4L-237ENST00000617539 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
NEDD4L-237ENST00000617539 TOPBP1Q92547 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
NEDD4L-237ENST00000617539 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.61■■■■■ 4.09
NEDD4L-237ENST00000617539 IFT140Q96RY7 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
NEDD4L-237ENST00000617539 ABCC8Q09428 1581 aa40.57■■■■■ 4.09
NEDD4L-237ENST00000617539 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
NEDD4L-237ENST00000617539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
NEDD4L-237ENST00000617539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
NEDD4L-237ENST00000617539 OSCARQ8IYS5 282 aa40.33■■■■■ 4.05
NEDD4L-237ENST00000617539 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
NEDD4L-237ENST00000617539 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
NEDD4L-237ENST00000617539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.026e-14■■■■■ 37.4
NEDD4L-237ENST00000617539 CUX1P39880 1505 aa40.18■■■■■ 4.02
NEDD4L-237ENST00000617539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.16■■■■■ 4.02
NEDD4L-237ENST00000617539 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.12■■■■■ 4.01
NEDD4L-237ENST00000617539 TRIM41Q8WV44 630 aa40.09■■■■■ 4.01
NEDD4L-237ENST00000617539 SOGA1O94964 1423 aa40.08■■■■■ 4.01
NEDD4L-237ENST00000617539 CHD1O14646 1710 aa40.02■■■■■ 4
NEDD4L-237ENST00000617539 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
NEDD4L-237ENST00000617539 WDR97A6NE52 1622 aa39.94■■■■□ 3.98
NEDD4L-237ENST00000617539 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
NEDD4L-237ENST00000617539 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
NEDD4L-237ENST00000617539 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.92■■■■□ 3.98
NEDD4L-237ENST00000617539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.81■■■■□ 3.96
NEDD4L-237ENST00000617539 ARHGEF11O15085 1522 aa39.8■■■■□ 3.96
NEDD4L-237ENST00000617539 FBLN2P98095 1184 aa39.74■■■■□ 3.95
NEDD4L-237ENST00000617539 GRIN2BQ13224 1484 aa39.72■■■■□ 3.95
NEDD4L-237ENST00000617539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 PBRM1Q86U86 1689 aa39.69■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.68■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.65■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.65■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.63■■■■□ 3.94
NEDD4L-237ENST00000617539 TOP2BQ02880 1626 aa39.62■■■■□ 3.93
NEDD4L-237ENST00000617539 SYNJ1O43426 1573 aa39.62■■■■□ 3.93
NEDD4L-237ENST00000617539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.93
NEDD4L-237ENST00000617539 SYNJ2O15056 1496 aa39.56■■■■□ 3.92
NEDD4L-237ENST00000617539 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.55■■■■□ 3.92
NEDD4L-237ENST00000617539 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
NEDD4L-237ENST00000617539 ARAP1Q96P48 1450 aa39.45■■■■□ 3.91
NEDD4L-237ENST00000617539 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.38■■■■□ 3.89
NEDD4L-237ENST00000617539 ADAMTS12P58397 1594 aa39.31■■■■□ 3.88
NEDD4L-237ENST00000617539 GRIN2AQ12879 1464 aa39.24■■■■□ 3.87
NEDD4L-237ENST00000617539 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
NEDD4L-237ENST00000617539 CEP170Q5SW79 1584 aa39.13■■■■□ 3.85
NEDD4L-237ENST00000617539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.13■■■■□ 3.85
NEDD4L-237ENST00000617539 NUP160Q12769 1436 aa39.1■■■■□ 3.85
NEDD4L-237ENST00000617539 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.99■■■■□ 3.83
NEDD4L-237ENST00000617539 SHROOM2Q13796 1616 aa38.94■■■■□ 3.82
NEDD4L-237ENST00000617539 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
NEDD4L-237ENST00000617539 KIF27Q86VH2 1401 aa38.77■■■■□ 3.8
NEDD4L-237ENST00000617539 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.77■■■■□ 3.8
NEDD4L-237ENST00000617539 IGF1RP08069 1367 aa38.74■■■■□ 3.79
NEDD4L-237ENST00000617539 CUL7Q14999 1698 aa38.71■■■■□ 3.79
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