RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403593.8

SDSL-202, Transcript of serine dehydratase like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDSL, Length 1,449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSL-202ENST00000403593 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.59■■■■■ 6.49
SDSL-202ENST00000403593 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.57■■■■■ 5.53
SDSL-202ENST00000403593 ABCC9O60706 1549 aa48.6■■■■■ 5.37
SDSL-202ENST00000403593 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.71■■■■■ 5.07
SDSL-202ENST00000403593 NACADO15069 1562 aa46.6■■■■■ 5.05
SDSL-202ENST00000403593 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.43■■■■■ 5.02
SDSL-202ENST00000403593 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
SDSL-202ENST00000403593 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.26■■■■■ 5
SDSL-202ENST00000403593 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46■■■■■ 4.95
SDSL-202ENST00000403593 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.78■■■■■ 4.92
SDSL-202ENST00000403593 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
SDSL-202ENST00000403593 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.33■■■■■ 4.85
SDSL-202ENST00000403593 SCRIBQ14160 1630 aa45.17■■■■■ 4.82
SDSL-202ENST00000403593 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.8■■■■■ 4.76
SDSL-202ENST00000403593 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.77■■■■■ 4.76
SDSL-202ENST00000403593 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
SDSL-202ENST00000403593 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.01■■■■■ 4.64
SDSL-202ENST00000403593 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.69■■■■■ 4.58
SDSL-202ENST00000403593 SMARCA4P51532 1647 aa43.2■■■■■ 4.51
SDSL-202ENST00000403593 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
SDSL-202ENST00000403593 NCAPD3P42695 1498 aa42.98■■■■■ 4.47
SDSL-202ENST00000403593 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.97■■■■■ 4.47
SDSL-202ENST00000403593 SMARCA2P51531 1590 aa42.93■■■■■ 4.46
SDSL-202ENST00000403593 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.84■■■■■ 4.45
SDSL-202ENST00000403593 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.79■■■■■ 4.44
SDSL-202ENST00000403593 HMGXB3Q12766 1538 aa42.78■■■■■ 4.44
SDSL-202ENST00000403593 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
SDSL-202ENST00000403593 WIZO95785 1651 aa42.41■■■■■ 4.38
SDSL-202ENST00000403593 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
SDSL-202ENST00000403593 NESP48681 1621 aa42.02■■■■■ 4.32
SDSL-202ENST00000403593 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.92■■■■■ 4.3
SDSL-202ENST00000403593 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
SDSL-202ENST00000403593 ERCC6Q03468 1493 aa41.9■■■■■ 4.3
SDSL-202ENST00000403593 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.7■■■■■ 4.27
SDSL-202ENST00000403593 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.6■■■■■ 4.25
SDSL-202ENST00000403593 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.58■■■■■ 4.25
SDSL-202ENST00000403593 CUX2O14529 1486 aa41.55■■■■■ 4.24
SDSL-202ENST00000403593 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
SDSL-202ENST00000403593 CFTRP13569 1480 aa41.43■■■■■ 4.22
SDSL-202ENST00000403593 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.39■■■■■ 4.22
SDSL-202ENST00000403593 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
SDSL-202ENST00000403593 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.24■■■■■ 4.19
SDSL-202ENST00000403593 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.21■■■■■ 4.19
SDSL-202ENST00000403593 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.18■■■■■ 4.18
SDSL-202ENST00000403593 WDR62O43379 1518 aa41.09■■■■■ 4.17
SDSL-202ENST00000403593 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SDSL-202ENST00000403593 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
SDSL-202ENST00000403593 TOPBP1Q92547 1522 aa40.57■■■■■ 4.08
SDSL-202ENST00000403593 ABCC8Q09428 1581 aa40.55■■■■■ 4.08
SDSL-202ENST00000403593 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.53■■■■■ 4.08
SDSL-202ENST00000403593 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.46■■■■■ 4.07
SDSL-202ENST00000403593 IFT140Q96RY7 1462 aa40.35■■■■■ 4.05
SDSL-202ENST00000403593 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
SDSL-202ENST00000403593 CUX1P39880 1505 aa40.2■■■■■ 4.03
SDSL-202ENST00000403593 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
SDSL-202ENST00000403593 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
SDSL-202ENST00000403593 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.09■■■■■ 4.01
SDSL-202ENST00000403593 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
SDSL-202ENST00000403593 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.02■■■■■ 4
SDSL-202ENST00000403593 SOGA1O94964 1423 aa40.01■■■■■ 4
SDSL-202ENST00000403593 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.92■■■■□ 3.98
SDSL-202ENST00000403593 WDR97A6NE52 1622 aa39.85■■■■□ 3.97
SDSL-202ENST00000403593 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.85■■■■□ 3.97
SDSL-202ENST00000403593 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
SDSL-202ENST00000403593 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
SDSL-202ENST00000403593 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
SDSL-202ENST00000403593 SYNJ1O43426 1573 aa39.8■■■■□ 3.96
SDSL-202ENST00000403593 OSCARQ8IYS5 282 aa39.74■■■■□ 3.95
SDSL-202ENST00000403593 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.69■■■■□ 3.94
SDSL-202ENST00000403593 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
SDSL-202ENST00000403593 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.59■■■■□ 3.93
SDSL-202ENST00000403593 PBRM1Q86U86 1689 aa39.59■■■■□ 3.93
SDSL-202ENST00000403593 GRIN2BQ13224 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
SDSL-202ENST00000403593 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.57■■■■□ 3.92
SDSL-202ENST00000403593 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.57■■■■□ 3.92
SDSL-202ENST00000403593 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
SDSL-202ENST00000403593 FBLN2P98095 1184 aa39.44■■■■□ 3.9
SDSL-202ENST00000403593 SYNJ2O15056 1496 aa39.36■■■■□ 3.89
SDSL-202ENST00000403593 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
SDSL-202ENST00000403593 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SDSL-202ENST00000403593 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SDSL-202ENST00000403593 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.22■■■■□ 3.87
SDSL-202ENST00000403593 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.22■■■■□ 3.87
SDSL-202ENST00000403593 ADAMTS12P58397 1594 aa39.21■■■■□ 3.87
SDSL-202ENST00000403593 ARHGEF11O15085 1522 aa39.16■■■■□ 3.86
SDSL-202ENST00000403593 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.15■■■■□ 3.86
SDSL-202ENST00000403593 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.09■■■■□ 3.85
SDSL-202ENST00000403593 GRIN2AQ12879 1464 aa39.09■■■■□ 3.85
SDSL-202ENST00000403593 TRIM41Q8WV44 630 aa39.04■■■■□ 3.84
SDSL-202ENST00000403593 KIF27Q86VH2 1401 aa39.01■■■■□ 3.84
SDSL-202ENST00000403593 CEP170Q5SW79 1584 aa38.93■■■■□ 3.82
SDSL-202ENST00000403593 NUP160Q12769 1436 aa38.92■■■■□ 3.82
SDSL-202ENST00000403593 IGF1RP08069 1367 aa38.88■■■■□ 3.81
SDSL-202ENST00000403593 CUL7Q14999 1698 aa38.86■■■■□ 3.81
SDSL-202ENST00000403593 ARAP1Q96P48 1450 aa38.83■■■■□ 3.81
SDSL-202ENST00000403593 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.75■■■■□ 3.79
SDSL-202ENST00000403593 SHROOM2Q13796 1616 aa38.7■■■■□ 3.79
SDSL-202ENST00000403593 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.64■■■■□ 3.78
SDSL-202ENST00000403593 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.64■■■■□ 3.78
SDSL-202ENST00000403593 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms