RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560550.1

NRL-205, Transcript of neural retina leucine zipper, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRL, Length 788 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRL-205	ENST00000560550	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.56	■■■■■ 6.48
NRL-205	ENST00000560550	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.74	■■■■■ 5.55
NRL-205	ENST00000560550	ABCC9	O60706	1549 aa		49.24	■■■■■ 5.47
NRL-205	ENST00000560550	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.11	■■■■■ 5.13
NRL-205	ENST00000560550	NACAD	O15069	1562 aa		46.9	■■■■■ 5.1
NRL-205	ENST00000560550	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.6	■■■■■ 5.05
NRL-205	ENST00000560550	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.41	■■■■■ 5.02
NRL-205	ENST00000560550	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.15	■■■■■ 4.98
NRL-205	ENST00000560550	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.06	■■■■■ 4.96
NRL-205	ENST00000560550	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.97	■■■■■ 4.95
NRL-205	ENST00000560550	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	45.86	■■■■■ 4.93
NRL-205	ENST00000560550	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.77	■■■■■ 4.92
NRL-205	ENST00000560550	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.71	■■■■■ 4.91
NRL-205	ENST00000560550	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.28	■■■■■ 4.84
NRL-205	ENST00000560550	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.21	■■■■■ 4.83
NRL-205	ENST00000560550	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.56	■■■■■ 4.72
NRL-205	ENST00000560550	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.53	■■■■■ 4.72
NRL-205	ENST00000560550	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.34	■■■■■ 4.69
NRL-205	ENST00000560550	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NRL-205	ENST00000560550	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NRL-205	ENST00000560550	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.18	■■■■■ 4.5
NRL-205	ENST00000560550	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.12	■■■■■ 4.49
NRL-205	ENST00000560550	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
NRL-205	ENST00000560550	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.02	■■■■■ 4.48
NRL-205	ENST00000560550	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.86	■■■■■ 4.45
NRL-205	ENST00000560550	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
NRL-205	ENST00000560550	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.79	■■■■■ 4.44
NRL-205	ENST00000560550	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.51	■■■■■ 4.4
NRL-205	ENST00000560550	NES	P48681	1621 aa		42.42	■■■■■ 4.38
NRL-205	ENST00000560550	CUX2	O14529	1486 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NRL-205	ENST00000560550	WIZ	O95785	1651 aa		42.31	■■■■■ 4.36
NRL-205	ENST00000560550	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.26	■■■■■ 4.36
NRL-205	ENST00000560550	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
NRL-205	ENST00000560550	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		41.97	■■■■■ 4.31
NRL-205	ENST00000560550	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
NRL-205	ENST00000560550	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.96	■■■■■ 4.31
NRL-205	ENST00000560550	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		41.93	■■■■■ 4.3
NRL-205	ENST00000560550	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.83	■■■■■ 4.29
NRL-205	ENST00000560550	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.78	■■■■■ 4.28
NRL-205	ENST00000560550	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.59	■■■■■ 4.25
NRL-205	ENST00000560550	CFTR	P13569	1480 aa		41.58	■■■■■ 4.25
NRL-205	ENST00000560550	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.51	■■■■■ 4.24
NRL-205	ENST00000560550	WDR62	O43379	1518 aa		41.49	■■■■■ 4.23
NRL-205	ENST00000560550	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.48	■■■■■ 4.23
NRL-205	ENST00000560550	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.31	■■■■■ 4.2
NRL-205	ENST00000560550	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.26	■■■■■ 4.2
NRL-205	ENST00000560550	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.12	■■■■■ 4.17
NRL-205	ENST00000560550	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.75	■■■■■ 4.11
NRL-205	ENST00000560550	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.72	■■■■■ 4.11
NRL-205	ENST00000560550	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.66	■■■■■ 4.1
NRL-205	ENST00000560550	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.66	■■■■■ 4.1
NRL-205	ENST00000560550	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
NRL-205	ENST00000560550	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
NRL-205	ENST00000560550	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.4	■■■■■ 4.06
NRL-205	ENST00000560550	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
NRL-205	ENST00000560550	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
NRL-205	ENST00000560550	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
NRL-205	ENST00000560550	CUX1	P39880	1505 aa		40.2	■■■■■ 4.03
NRL-205	ENST00000560550	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.19	■■■■■ 4.03
NRL-205	ENST00000560550	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.17	■■■■■ 4.02
NRL-205	ENST00000560550	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.16	■■■■■ 4.02
NRL-205	ENST00000560550	SOGA1	O94964	1423 aa		40.16	■■■■■ 4.02
NRL-205	ENST00000560550	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.07	■■■■■ 4.01
NRL-205	ENST00000560550	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.05	■■■■■ 4
NRL-205	ENST00000560550	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
NRL-205	ENST00000560550	CHD1	O14646	1710 aa		39.99	■■■■□ 3.99
NRL-205	ENST00000560550	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.88	■■■■□ 3.97
NRL-205	ENST00000560550	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.88	■■■■□ 3.97
NRL-205	ENST00000560550	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.88	■■■■□ 3.97
NRL-205	ENST00000560550	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.83	■■■■□ 3.97
NRL-205	ENST00000560550	FBLN2	P98095	1184 aa		39.82	■■■■□ 3.97
NRL-205	ENST00000560550	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.8	■■■■□ 3.96
NRL-205	ENST00000560550	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.8	■■■■□ 3.96
NRL-205	ENST00000560550	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.77	■■■■□ 3.96
NRL-205	ENST00000560550	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.75	■■■■□ 3.95
NRL-205	ENST00000560550	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.7	■■■■□ 3.95
NRL-205	ENST00000560550	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.7	■■■■□ 3.95
NRL-205	ENST00000560550	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.7	■■■■□ 3.95
NRL-205	ENST00000560550	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.69	■■■■□ 3.94
NRL-205	ENST00000560550	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.67	■■■■□ 3.94
NRL-205	ENST00000560550	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.66	■■■■□ 3.94
NRL-205	ENST00000560550	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.63	■■■■□ 3.93
NRL-205	ENST00000560550	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.62	■■■■□ 3.93
NRL-205	ENST00000560550	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.62	■■■■□ 3.93
NRL-205	ENST00000560550	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.55	■■■■□ 3.92
NRL-205	ENST00000560550	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.43	■■■■□ 3.9
NRL-205	ENST00000560550	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.41	■■■■□ 3.9
NRL-205	ENST00000560550	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.33	■■■■□ 3.89
NRL-205	ENST00000560550	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.29	■■■■□ 3.88
NRL-205	ENST00000560550	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.27	■■■■□ 3.88
NRL-205	ENST00000560550	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.23	■■■■□ 3.87
NRL-205	ENST00000560550	NUP160	Q12769	1436 aa		39.14	■■■■□ 3.86
NRL-205	ENST00000560550	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.12	■■■■□ 3.85
NRL-205	ENST00000560550	SHROOM2	Q13796	1616 aa		38.95	■■■■□ 3.83
NRL-205	ENST00000560550	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		38.91	■■■■□ 3.82
NRL-205	ENST00000560550	KIF27	Q86VH2	1401 aa		38.9	■■■■□ 3.82
NRL-205	ENST00000560550	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	38.83	■■■■□ 3.81
NRL-205	ENST00000560550	IGF1R	P08069	1367 aa		38.81	■■■■□ 3.8
NRL-205	ENST00000560550	CUL7	Q14999	1698 aa		38.8	■■■■□ 3.8
NRL-205	ENST00000560550	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		38.78	■■■■□ 3.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms