RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263270.10

AP2S1-201, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene AP2S1, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-201ENST00000263270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.26■■■■■ 6.44
AP2S1-201ENST00000263270 ABCC9O60706 1549 aa50.17■■■■■ 5.62
AP2S1-201ENST00000263270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.76■■■■■ 5.56
AP2S1-201ENST00000263270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.54■■■■■ 5.2
AP2S1-201ENST00000263270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.41■■■■■ 5.18
AP2S1-201ENST00000263270 NACADO15069 1562 aa47.11■■■■■ 5.13
AP2S1-201ENST00000263270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.84■■■■■ 5.09
AP2S1-201ENST00000263270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.65■■■■■ 5.06
AP2S1-201ENST00000263270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.55■■■■■ 5.04
AP2S1-201ENST00000263270 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.3■■■■■ 5
AP2S1-201ENST00000263270 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
AP2S1-201ENST00000263270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
AP2S1-201ENST00000263270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.58■■■■■ 4.89
AP2S1-201ENST00000263270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.46■■■■■ 4.87
AP2S1-201ENST00000263270 SCRIBQ14160 1630 aa45.37■■■■■ 4.85
AP2S1-201ENST00000263270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.3■■■■■ 4.84
AP2S1-201ENST00000263270 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.21■■■■■ 4.83
AP2S1-201ENST00000263270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
AP2S1-201ENST00000263270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.76■■■■■ 4.6
AP2S1-201ENST00000263270 NCAPD3P42695 1498 aa43.5■■■■■ 4.55
AP2S1-201ENST00000263270 CUX2O14529 1486 aa43.34■■■■■ 4.53
AP2S1-201ENST00000263270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.33■■■■■ 4.53
AP2S1-201ENST00000263270 ERCC6Q03468 1493 aa43.32■■■■■ 4.52
AP2S1-201ENST00000263270 SMARCA4P51532 1647 aa43.22■■■■■ 4.51
AP2S1-201ENST00000263270 SMARCA2P51531 1590 aa43.18■■■■■ 4.5
AP2S1-201ENST00000263270 HMGXB3Q12766 1538 aa43.15■■■■■ 4.5
AP2S1-201ENST00000263270 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
AP2S1-201ENST00000263270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
AP2S1-201ENST00000263270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
AP2S1-201ENST00000263270 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.77■■■■■ 4.44
AP2S1-201ENST00000263270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
AP2S1-201ENST00000263270 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
AP2S1-201ENST00000263270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.59■■■■■ 4.41
AP2S1-201ENST00000263270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.45■■■■■ 4.39
AP2S1-201ENST00000263270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.34■■■■■ 4.37
AP2S1-201ENST00000263270 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.15■■■■■ 4.34
AP2S1-201ENST00000263270 WIZO95785 1651 aa42.1■■■■■ 4.33
AP2S1-201ENST00000263270 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.03■■■■■ 4.32
AP2S1-201ENST00000263270 WDR62O43379 1518 aa41.95■■■■■ 4.31
AP2S1-201ENST00000263270 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.79■■■■■ 4.28
AP2S1-201ENST00000263270 TRIM41Q8WV44 630 aa41.73■■■■■ 4.27
AP2S1-201ENST00000263270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.71■■■■■ 4.27
AP2S1-201ENST00000263270 CFTRP13569 1480 aa41.61■■■■■ 4.25
AP2S1-201ENST00000263270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
AP2S1-201ENST00000263270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
AP2S1-201ENST00000263270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
AP2S1-201ENST00000263270 OSCARQ8IYS5 282 aa41.29■■■■■ 4.2
AP2S1-201ENST00000263270 PRDM2Q13029 1718 aa41.21■■■■■ 4.19
AP2S1-201ENST00000263270 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.04■■■■■ 4.16
AP2S1-201ENST00000263270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
AP2S1-201ENST00000263270 IFT140Q96RY7 1462 aa40.95■■■■■ 4.15
AP2S1-201ENST00000263270 TOPBP1Q92547 1522 aa40.88■■■■■ 4.14
AP2S1-201ENST00000263270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
AP2S1-201ENST00000263270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
AP2S1-201ENST00000263270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
AP2S1-201ENST00000263270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
AP2S1-201ENST00000263270 ABCC8Q09428 1581 aa40.71■■■■■ 4.11
AP2S1-201ENST00000263270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.69■■■■■ 4.11
AP2S1-201ENST00000263270 ARHGEF11O15085 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
AP2S1-201ENST00000263270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
AP2S1-201ENST00000263270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
AP2S1-201ENST00000263270 CHD1O14646 1710 aa40.52■■■■■ 4.08
AP2S1-201ENST00000263270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
AP2S1-201ENST00000263270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.39■■■■■ 4.06
AP2S1-201ENST00000263270 FBLN2P98095 1184 aa40.34■■■■■ 4.05
AP2S1-201ENST00000263270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.32■■■■■ 4.05
AP2S1-201ENST00000263270 ARAP1Q96P48 1450 aa40.26■■■■■ 4.04
AP2S1-201ENST00000263270 SOGA1O94964 1423 aa40.24■■■■■ 4.03
AP2S1-201ENST00000263270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
AP2S1-201ENST00000263270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.14■■■■■ 4.02
AP2S1-201ENST00000263270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.12■■■■■ 4.01
AP2S1-201ENST00000263270 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
AP2S1-201ENST00000263270 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
AP2S1-201ENST00000263270 WDR97A6NE52 1622 aa40.05■■■■■ 4
AP2S1-201ENST00000263270 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.01■■■■□ 3.99
AP2S1-201ENST00000263270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
AP2S1-201ENST00000263270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
AP2S1-201ENST00000263270 SYNJ1O43426 1573 aa39.93■■■■□ 3.98
AP2S1-201ENST00000263270 GRIN2BQ13224 1484 aa39.92■■■■□ 3.98
AP2S1-201ENST00000263270 SYNJ2O15056 1496 aa39.84■■■■□ 3.97
AP2S1-201ENST00000263270 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
AP2S1-201ENST00000263270 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.75■■■■□ 3.95
AP2S1-201ENST00000263270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.65■■■■□ 3.94
AP2S1-201ENST00000263270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.64■■■■□ 3.94
AP2S1-201ENST00000263270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
AP2S1-201ENST00000263270 GRIN2AQ12879 1464 aa39.43■■■■□ 3.9
AP2S1-201ENST00000263270 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.4■■■■□ 3.9
AP2S1-201ENST00000263270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
AP2S1-201ENST00000263270 ADAMTS12P58397 1594 aa39.38■■■■□ 3.89
AP2S1-201ENST00000263270 CEP170Q5SW79 1584 aa39.33■■■■□ 3.89
AP2S1-201ENST00000263270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.31■■■■□ 3.88
AP2S1-201ENST00000263270 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
AP2S1-201ENST00000263270 TOP2BQ02880 1626 aa39.29■■■■□ 3.88
AP2S1-201ENST00000263270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.21■■■■□ 3.87
AP2S1-201ENST00000263270 SHROOM2Q13796 1616 aa39.18■■■■□ 3.86
AP2S1-201ENST00000263270 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
AP2S1-201ENST00000263270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
AP2S1-201ENST00000263270 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
AP2S1-201ENST00000263270 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.91■■■■□ 3.82
AP2S1-201ENST00000263270 JPH4Q96JJ6 628 aa38.88■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms