RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567594.1

SSSCA1-AS1-201, Transcript of SSSCA1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SSSCA1-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.76■■■■■ 6.52
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.32■■■■■ 5.49
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ABCC9O60706 1549 aa47.56■■■■■ 5.2
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.04
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.3■■■■■ 5
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NACADO15069 1562 aa46.27■■■■■ 5
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.26■■■■■ 5
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.25■■■■■ 4.99
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.14■■■■■ 4.98
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SCRIBQ14160 1630 aa44.92■■■■■ 4.78
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.92■■■■■ 4.78
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.6■■■■■ 4.73
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.42■■■■■ 4.7
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.27■■■■■ 4.52
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SMARCA4P51532 1647 aa43.09■■■■■ 4.49
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.07■■■■■ 4.48
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.04■■■■■ 4.48
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.9■■■■■ 4.46
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SMARCA2P51531 1590 aa42.78■■■■■ 4.44
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.74■■■■■ 4.43
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NCAPD3P42695 1498 aa42.68■■■■■ 4.42
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HMGXB3Q12766 1538 aa42.51■■■■■ 4.39
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WIZO95785 1651 aa42.44■■■■■ 4.39
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.61■■■■■ 4.25
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.47■■■■■ 4.23
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.44■■■■■ 4.22
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CFTRP13569 1480 aa41.34■■■■■ 4.21
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NESP48681 1621 aa41.29■■■■■ 4.2
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.18■■■■■ 4.18
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ERCC6Q03468 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRDM2Q13029 1718 aa40.99■■■■■ 4.15
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.94■■■■■ 4.14
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.85■■■■■ 4.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.83■■■■■ 4.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.65■■■■■ 4.1
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ABCC8Q09428 1581 aa40.52■■■■■ 4.08
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WDR62O43379 1518 aa40.49■■■■■ 4.07
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CUX2O14529 1486 aa40.42■■■■■ 4.06
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.36■■■■■ 4.05
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TOPBP1Q92547 1522 aa40.34■■■■■ 4.05
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CUX1P39880 1505 aa40.22■■■■■ 4.03
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TOP2BQ02880 1626 aa40.09■■■■■ 4.01
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.07■■■■■ 4.01
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SYNJ1O43426 1573 aa40.03■■■■■ 4
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.01■■■■■ 4
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IFT140Q96RY7 1462 aa40■■■■□ 3.99
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SOGA1O94964 1423 aa39.93■■■■□ 3.98
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.8■■■■□ 3.96
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TRIM41Q8WV44 630 aa39.78■■■■□ 3.96
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.72■■■■□ 3.95
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.63■■■■□ 3.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.52■■■■□ 3.92
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.47■■■■□ 3.91
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.44■■■■□ 3.9
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIF27Q86VH2 1401 aa39.43■■■■□ 3.9
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GRIN2BQ13224 1484 aa39.41■■■■□ 3.9
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.28■■■■□ 3.88
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PBRM1Q86U86 1689 aa39.25■■■■□ 3.87
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.18■■■■□ 3.86
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EEA1Q15075 1411 aa39.15■■■■□ 3.86
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IGF1RP08069 1367 aa39.15■■■■□ 3.86
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.08■■■■□ 3.85
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.07■■■■□ 3.85
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SYNJ2O15056 1496 aa39.06■■■■□ 3.84
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CUL7Q14999 1698 aa39.01■■■■□ 3.84
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ADAMTS12P58397 1594 aa39.01■■■■□ 3.84
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FBLN2P98095 1184 aa38.97■■■■□ 3.83
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.95■■■■□ 3.83
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.94■■■■□ 3.82
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 OSCARQ8IYS5 282 aa38.89■■■■□ 3.82
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHD1O14646 1710 aa38.87■■■■□ 3.81
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GRIN2AQ12879 1464 aa38.86■■■■□ 3.81
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRXQ9BXM0 1461 aa38.79■■■■□ 3.8
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NUP160Q12769 1436 aa38.68■■■■□ 3.78
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIF21BO75037 1637 aa38.58■■■■□ 3.77
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CEP170Q5SW79 1584 aa38.57■■■■□ 3.76
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.53■■■■□ 3.76
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.5■■■■□ 3.75
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms