RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.45■■■■■ 6.47
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.77■■■■■ 5.4
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC9O60706 1549 aa47.56■■■■■ 5.2
MEIS3-204ENST00000558555 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
MEIS3-204ENST00000558555 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.96■■■■■ 4.95
MEIS3-204ENST00000558555 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.9■■■■■ 4.94
MEIS3-204ENST00000558555 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.63■■■■■ 4.9
MEIS3-204ENST00000558555 NACADO15069 1562 aa45.55■■■■■ 4.88
MEIS3-204ENST00000558555 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.51■■■■■ 4.88
MEIS3-204ENST00000558555 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
MEIS3-204ENST00000558555 SCRIBQ14160 1630 aa44.65■■■■■ 4.74
MEIS3-204ENST00000558555 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.63■■■■■ 4.73
MEIS3-204ENST00000558555 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.44■■■■■ 4.71
MEIS3-204ENST00000558555 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.23■■■■■ 4.67
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.96■■■■■ 4.63
MEIS3-204ENST00000558555 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
MEIS3-204ENST00000558555 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
MEIS3-204ENST00000558555 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.98■■■■■ 4.47
MEIS3-204ENST00000558555 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
MEIS3-204ENST00000558555 SMARCA4P51532 1647 aa42.79■■■■■ 4.44
MEIS3-204ENST00000558555 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.76■■■■■ 4.44
MEIS3-204ENST00000558555 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
MEIS3-204ENST00000558555 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
MEIS3-204ENST00000558555 WIZO95785 1651 aa42.4■■■■■ 4.38
MEIS3-204ENST00000558555 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.3■■■■■ 4.36
MEIS3-204ENST00000558555 SMARCA2P51531 1590 aa42.26■■■■■ 4.35
MEIS3-204ENST00000558555 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.21■■■■■ 4.35
MEIS3-204ENST00000558555 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
MEIS3-204ENST00000558555 NCAPD3P42695 1498 aa41.98■■■■■ 4.31
MEIS3-204ENST00000558555 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
MEIS3-204ENST00000558555 HMGXB3Q12766 1538 aa41.92■■■■■ 4.3
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.5■■■■■ 4.23
MEIS3-204ENST00000558555 NESP48681 1621 aa41.11■■■■■ 4.17
MEIS3-204ENST00000558555 ERCC6Q03468 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
MEIS3-204ENST00000558555 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.86■■■■■ 4.13
MEIS3-204ENST00000558555 CFTRP13569 1480 aa40.86■■■■■ 4.13
MEIS3-204ENST00000558555 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.83■■■■■ 4.13
MEIS3-204ENST00000558555 PRDM2Q13029 1718 aa40.72■■■■■ 4.11
MEIS3-204ENST00000558555 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.6■■■■■ 4.09
MEIS3-204ENST00000558555 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.55■■■■■ 4.08
MEIS3-204ENST00000558555 CUX2O14529 1486 aa40.54■■■■■ 4.08
MEIS3-204ENST00000558555 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.5■■■■■ 4.07
MEIS3-204ENST00000558555 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
MEIS3-204ENST00000558555 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.41■■■■■ 4.06
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC8Q09428 1581 aa40.39■■■■■ 4.06
MEIS3-204ENST00000558555 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
MEIS3-204ENST00000558555 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.26■■■■■ 4.04
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM41Q8WV44 630 aa40.24■■■■■ 4.03
MEIS3-204ENST00000558555 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
MEIS3-204ENST00000558555 SYNJ1O43426 1573 aa40.1■■■■■ 4.01
MEIS3-204ENST00000558555 WDR62O43379 1518 aa40.06■■■■■ 4
MEIS3-204ENST00000558555 CUX1P39880 1505 aa40.05■■■■■ 4
MEIS3-204ENST00000558555 TOP2BQ02880 1626 aa40.04■■■■■ 4
MEIS3-204ENST00000558555 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
MEIS3-204ENST00000558555 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.96■■■■□ 3.99
MEIS3-204ENST00000558555 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
MEIS3-204ENST00000558555 TOPBP1Q92547 1522 aa39.9■■■■□ 3.98
MEIS3-204ENST00000558555 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.68■■■■□ 3.94
MEIS3-204ENST00000558555 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
MEIS3-204ENST00000558555 SOGA1O94964 1423 aa39.51■■■■□ 3.92
MEIS3-204ENST00000558555 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.46■■■■□ 3.91
MEIS3-204ENST00000558555 EEA1Q15075 1411 aa39.42■■■■□ 3.9
MEIS3-204ENST00000558555 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
MEIS3-204ENST00000558555 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.39■■■■□ 3.9
MEIS3-204ENST00000558555 KIF27Q86VH2 1401 aa39.35■■■■□ 3.89
MEIS3-204ENST00000558555 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
MEIS3-204ENST00000558555 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.34■■■■□ 3.89
MEIS3-204ENST00000558555 IFT140Q96RY7 1462 aa39.34■■■■□ 3.89
MEIS3-204ENST00000558555 WDR97A6NE52 1622 aa39.33■■■■□ 3.89
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
MEIS3-204ENST00000558555 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.19■■■■□ 3.86
MEIS3-204ENST00000558555 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
MEIS3-204ENST00000558555 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.13■■■■□ 3.85
MEIS3-204ENST00000558555 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
MEIS3-204ENST00000558555 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.08■■■■□ 3.85
MEIS3-204ENST00000558555 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.84
MEIS3-204ENST00000558555 IGF1RP08069 1367 aa39■■■■□ 3.83
MEIS3-204ENST00000558555 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.96■■■■□ 3.83
MEIS3-204ENST00000558555 PBRM1Q86U86 1689 aa38.94■■■■□ 3.82
MEIS3-204ENST00000558555 KIF21BO75037 1637 aa38.91■■■■□ 3.82
MEIS3-204ENST00000558555 GRIN2BQ13224 1484 aa38.9■■■■□ 3.82
MEIS3-204ENST00000558555 OSCARQ8IYS5 282 aa38.88■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 CUL7Q14999 1698 aa38.87■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.87■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 PRXQ9BXM0 1461 aa38.86■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.83■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.83■■■■□ 3.81
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA3Q08378 1498 aa38.8■■■■□ 3.8
MEIS3-204ENST00000558555 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.73■■■■□ 3.79
MEIS3-204ENST00000558555 CHD1O14646 1710 aa38.69■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.68■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 ADAMTS12P58397 1594 aa38.68■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.67■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 FBLN2P98095 1184 aa38.64■■■■□ 3.78
MEIS3-204ENST00000558555 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.53■■■■□ 3.76
MEIS3-204ENST00000558555 SYNJ2O15056 1496 aa38.49■■■■□ 3.75
MEIS3-204ENST00000558555 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
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