Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 TRIM50-204ENST00000493498 555 ntTSL 410.8□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 215.89■□□□□ 0.133e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.413e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 412.18□□□□□ -0.463e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 38.23□□□□□ -1.093e-25■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 C3-218ENST00000602229 585 ntTSL 28.71□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 C3-212ENST00000599899 1992 ntTSL 27.35□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 C3-211ENST00000599668 627 ntTSL 36.09□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 34.8
RBFOX2O43251 FN1-213ENST00000456923 3720 ntTSL 25.92□□□□□ -1.461e-11■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 FN1-224ENST00000492816 9171 ntTSL 54.64□□□□□ -1.671e-11■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.137e-10■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 34.7
RBFOX2O43251 MACF1-202ENST00000360115 2824 ntTSL 511.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-207ENST00000442046 2299 ntTSL 511.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-208ENST00000446276 2559 ntTSL 59.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-206ENST00000422234 477 ntTSL 56.11□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-210ENST00000462496 526 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 ST3GAL6-223ENST00000493953 697 ntTSL 32.58□□□□□ -23e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 ST3GAL6-212ENST00000477899 803 ntTSL 52.39□□□□□ -2.033e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 ST3GAL6-209ENST00000474595 525 ntTSL 31.62□□□□□ -2.153e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-212ENST00000505453 1430 ntTSL 58.41□□□□□ -1.069e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-207ENST00000405755 2294 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-201ENST00000309641 2025 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.269e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.369e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.519e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.549e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.759e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 318.2■□□□□ 0.58e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)1.53□□□□□ -2.168e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)0.63□□□□□ -2.318e-8■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 B3GNTL1-209ENST00000573363 471 ntTSL 210.9□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-206ENST00000578312 692 ntTSL 412.05□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-214ENST00000583742 544 ntTSL 412.05□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-217ENST00000584354 544 ntTSL 211.7□□□□□ -0.545e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.825e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.965e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.965e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-215ENST00000583786 481 ntTSL 58.99□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.012e-13■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-208ENST00000581089 697 ntTSL 28.23□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-211ENST00000582208 625 ntTSL 37.7□□□□□ -1.185e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-210ENST00000581440 943 ntTSL 37.56□□□□□ -1.25e-9■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.242e-13■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 32.45□□□□□ -2.022e-13■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 MAN2C1-229ENST00000566013 775 ntTSL 312.37□□□□□ -0.431e-14■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-202ENST00000518720 583 ntTSL 413.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 412.06□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 34.6
RBFOX2O43251 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 216.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 59.66□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-37■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 ARFGAP1-207ENST00000518618 1244 ntTSL 213.75□□□□□ -0.211e-37■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 LRCH4-208ENST00000490359 540 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-14■■■■■ 34.5
RBFOX2O43251 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 ATP8B3-205ENST00000531925 5237 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-10■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 ATP8B3-207ENST00000533993 882 ntTSL 310.14□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 ATP8B3-203ENST00000526092 2759 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.94e-10■■■■■ 34.4
RBFOX2O43251 MGST1-218ENST00000543076 406 ntTSL 311.1□□□□□ -0.635e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-206ENST00000534835 279 ntTSL 511.1□□□□□ -0.635e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-213ENST00000539036 566 ntTSL 47.95□□□□□ -1.145e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.155e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-217ENST00000542256 933 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.165e-22■■■■■ 34.3
RBFOX2O43251 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.725e-22■■■■■ 34.3
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