RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.31■■■■□ 3.56
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TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.53■■■□□ 2.64
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TSNARE1-206ENST00000520462 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.15■■■□□ 2.58
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TSNARE1-206ENST00000520462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.31■■■□□ 2.44
TSNARE1-206ENST00000520462 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.25■■■□□ 2.43
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TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.49■■■□□ 2.31
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TSNARE1-206ENST00000520462 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
TSNARE1-206ENST00000520462 SMARCA2P51531 1590 aa29.07■■■□□ 2.24
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TSNARE1-206ENST00000520462 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.76■■■□□ 2.19
TSNARE1-206ENST00000520462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.59■■■□□ 2.17
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TSNARE1-206ENST00000520462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.45■■■□□ 2.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
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TSNARE1-206ENST00000520462 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.21■■■□□ 2.11
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TSNARE1-206ENST00000520462 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-206ENST00000520462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CFTRP13569 1480 aa28.02■■■□□ 2.08
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TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM41Q8WV44 630 aa27.8■■■□□ 2.04
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.8■■■□□ 2.04
TSNARE1-206ENST00000520462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TSNARE1-206ENST00000520462 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
TSNARE1-206ENST00000520462 OSCARQ8IYS5 282 aa27.65■■■□□ 2.02
TSNARE1-206ENST00000520462 IFT140Q96RY7 1462 aa27.53■■■□□ 2
TSNARE1-206ENST00000520462 TOPBP1Q92547 1522 aa27.51■■■□□ 2
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC8Q09428 1581 aa27.44■■□□□ 1.98
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TSNARE1-206ENST00000520462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
TSNARE1-206ENST00000520462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
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TSNARE1-206ENST00000520462 FBLN2P98095 1184 aa27.18■■□□□ 1.94
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF11O15085 1522 aa27.17■■□□□ 1.94
TSNARE1-206ENST00000520462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.16■■□□□ 1.94
TSNARE1-206ENST00000520462 CHD1O14646 1710 aa27.15■■□□□ 1.94
TSNARE1-206ENST00000520462 SOGA1O94964 1423 aa27.14■■□□□ 1.93
TSNARE1-206ENST00000520462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TSNARE1-206ENST00000520462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.07■■□□□ 1.92
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TSNARE1-206ENST00000520462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.98■■□□□ 1.91
TSNARE1-206ENST00000520462 WDR97A6NE52 1622 aa26.94■■□□□ 1.9
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TSNARE1-206ENST00000520462 ARAP1Q96P48 1450 aa26.9■■□□□ 1.9
TSNARE1-206ENST00000520462 GRIN2BQ13224 1484 aa26.89■■□□□ 1.9
TSNARE1-206ENST00000520462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TSNARE1-206ENST00000520462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-206ENST00000520462 SYNJ1O43426 1573 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-206ENST00000520462 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.8■■□□□ 1.88
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TSNARE1-206ENST00000520462 SYNJ2O15056 1496 aa26.8■■□□□ 1.88
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TSNARE1-206ENST00000520462 PBRM1Q86U86 1689 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-206ENST00000520462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-206ENST00000520462 TOP2BQ02880 1626 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.73■■□□□ 1.87
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TSNARE1-206ENST00000520462 GRIN2AQ12879 1464 aa26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-206ENST00000520462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP170Q5SW79 1584 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-206ENST00000520462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-206ENST00000520462 NUP160Q12769 1436 aa26.42■■□□□ 1.82
TSNARE1-206ENST00000520462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.39■■□□□ 1.82
TSNARE1-206ENST00000520462 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-206ENST00000520462 SHROOM2Q13796 1616 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF27Q86VH2 1401 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-206ENST00000520462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-206ENST00000520462 JPH4Q96JJ6 628 aa26.21■■□□□ 1.79
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