RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.83■■□□□ 1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.26■□□□□ 0.67
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC9O60706 1549 aa18.81■□□□□ 0.6
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-201ENST00000309641 NACADO15069 1562 aa18.08■□□□□ 0.48
PDE4D-201ENST00000309641 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.06■□□□□ 0.48
PDE4D-201ENST00000309641 MYO15BQ96JP2 1530 aa18■□□□□ 0.47
PDE4D-201ENST00000309641 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18■□□□□ 0.47
PDE4D-201ENST00000309641 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.72■□□□□ 0.43
PDE4D-201ENST00000309641 SCRIBQ14160 1630 aa17.68■□□□□ 0.42
PDE4D-201ENST00000309641 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
PDE4D-201ENST00000309641 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.59■□□□□ 0.41
PDE4D-201ENST00000309641 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.45■□□□□ 0.38
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.18■□□□□ 0.34
PDE4D-201ENST00000309641 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
PDE4D-201ENST00000309641 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.06■□□□□ 0.32
PDE4D-201ENST00000309641 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.98■□□□□ 0.31
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCA4P51532 1647 aa16.9■□□□□ 0.3
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PDE4D-201ENST00000309641 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.87■□□□□ 0.29
PDE4D-201ENST00000309641 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-201ENST00000309641 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PDE4D-201ENST00000309641 NCAPD3P42695 1498 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCA2P51531 1590 aa16.71■□□□□ 0.27
PDE4D-201ENST00000309641 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.7■□□□□ 0.26
PDE4D-201ENST00000309641 WIZO95785 1651 aa16.69■□□□□ 0.26
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PDE4D-201ENST00000309641 HMGXB3Q12766 1538 aa16.62■□□□□ 0.25
PDE4D-201ENST00000309641 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PDE4D-201ENST00000309641 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PDE4D-201ENST00000309641 NESP48681 1621 aa16.35■□□□□ 0.21
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.32■□□□□ 0.2
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PDE4D-201ENST00000309641 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.22■□□□□ 0.19
PDE4D-201ENST00000309641 CFTRP13569 1480 aa16.19■□□□□ 0.18
PDE4D-201ENST00000309641 ERCC6Q03468 1493 aa16.14■□□□□ 0.17
PDE4D-201ENST00000309641 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.11■□□□□ 0.17
PDE4D-201ENST00000309641 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.1■□□□□ 0.17
PDE4D-201ENST00000309641 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.07■□□□□ 0.16
PDE4D-201ENST00000309641 PRDM2Q13029 1718 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-201ENST00000309641 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-201ENST00000309641 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDE4D-201ENST00000309641 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.95■□□□□ 0.14
PDE4D-201ENST00000309641 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PDE4D-201ENST00000309641 WDR62O43379 1518 aa15.89■□□□□ 0.13
PDE4D-201ENST00000309641 CUX2O14529 1486 aa15.87■□□□□ 0.13
PDE4D-201ENST00000309641 TOPBP1Q92547 1522 aa15.84■□□□□ 0.13
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC8Q09428 1581 aa15.81■□□□□ 0.12
PDE4D-201ENST00000309641 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.81■□□□□ 0.12
PDE4D-201ENST00000309641 CUX1P39880 1505 aa15.8■□□□□ 0.12
PDE4D-201ENST00000309641 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
PDE4D-201ENST00000309641 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PDE4D-201ENST00000309641 SYNJ1O43426 1573 aa15.72■□□□□ 0.11
PDE4D-201ENST00000309641 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.71■□□□□ 0.11
PDE4D-201ENST00000309641 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.69■□□□□ 0.1
PDE4D-201ENST00000309641 TOP2BQ02880 1626 aa15.67■□□□□ 0.1
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PDE4D-201ENST00000309641 SOGA1O94964 1423 aa15.66■□□□□ 0.1
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PDE4D-201ENST00000309641 IFT140Q96RY7 1462 aa15.65■□□□□ 0.1
PDE4D-201ENST00000309641 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PDE4D-201ENST00000309641 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-201ENST00000309641 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
PDE4D-201ENST00000309641 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PDE4D-201ENST00000309641 WDR97A6NE52 1622 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.54■□□□□ 0.08
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM41Q8WV44 630 aa15.5■□□□□ 0.07
PDE4D-201ENST00000309641 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4D-201ENST00000309641 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4D-201ENST00000309641 GRIN2BQ13224 1484 aa15.42■□□□□ 0.06
PDE4D-201ENST00000309641 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.41■□□□□ 0.06
PDE4D-201ENST00000309641 PBRM1Q86U86 1689 aa15.41■□□□□ 0.06
PDE4D-201ENST00000309641 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.4■□□□□ 0.06
PDE4D-201ENST00000309641 KIF27Q86VH2 1401 aa15.37■□□□□ 0.05
PDE4D-201ENST00000309641 FBLN2P98095 1184 aa15.37■□□□□ 0.05
PDE4D-201ENST00000309641 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDE4D-201ENST00000309641 IGF1RP08069 1367 aa15.34■□□□□ 0.05
PDE4D-201ENST00000309641 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.33■□□□□ 0.05
PDE4D-201ENST00000309641 CHD1O14646 1710 aa15.32■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 SYNJ2O15056 1496 aa15.3■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 ADAMTS12P58397 1594 aa15.3■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 OSCARQ8IYS5 282 aa15.29■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.28■□□□□ 0.04
PDE4D-201ENST00000309641 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.25■□□□□ 0.03
PDE4D-201ENST00000309641 GRIN2AQ12879 1464 aa15.24■□□□□ 0.03
PDE4D-201ENST00000309641 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.23■□□□□ 0.03
PDE4D-201ENST00000309641 CUL7Q14999 1698 aa15.21■□□□□ 0.03
PDE4D-201ENST00000309641 CEP170Q5SW79 1584 aa15.18■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.18■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 NUP160Q12769 1436 aa15.17■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.16■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 PRXQ9BXM0 1461 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 EEA1Q15075 1411 aa15.15■□□□□ 0.02
PDE4D-201ENST00000309641 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.14■□□□□ 0.01
PDE4D-201ENST00000309641 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.09■□□□□ 0.01
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGEF11O15085 1522 aa15.05■□□□□ -0
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