RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518720.5

TSNARE1-202, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-202ENST00000518720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.77■■■■■ 4.12
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TSNARE1-202ENST00000518720 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.87■■■■□ 3.01
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TSNARE1-202ENST00000518720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.72■■■□□ 2.99
TSNARE1-202ENST00000518720 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.71■■■□□ 2.99
TSNARE1-202ENST00000518720 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.63■■■□□ 2.97
TSNARE1-202ENST00000518720 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.08■■■□□ 2.89
TSNARE1-202ENST00000518720 SCRIBQ14160 1630 aa33.05■■■□□ 2.88
TSNARE1-202ENST00000518720 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.66■■■□□ 2.82
TSNARE1-202ENST00000518720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.61■■■□□ 2.81
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TSNARE1-202ENST00000518720 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.71■■■□□ 2.67
TSNARE1-202ENST00000518720 SMARCA4P51532 1647 aa31.6■■■□□ 2.65
TSNARE1-202ENST00000518720 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
TSNARE1-202ENST00000518720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.54■■■□□ 2.64
TSNARE1-202ENST00000518720 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.46■■■□□ 2.63
TSNARE1-202ENST00000518720 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.39■■■□□ 2.62
TSNARE1-202ENST00000518720 SMARCA2P51531 1590 aa31.24■■■□□ 2.59
TSNARE1-202ENST00000518720 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TSNARE1-202ENST00000518720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.22■■■□□ 2.59
TSNARE1-202ENST00000518720 WIZO95785 1651 aa31.21■■■□□ 2.59
TSNARE1-202ENST00000518720 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.2■■■□□ 2.58
TSNARE1-202ENST00000518720 NCAPD3P42695 1498 aa31.08■■■□□ 2.57
TSNARE1-202ENST00000518720 HMGXB3Q12766 1538 aa31.06■■■□□ 2.56
TSNARE1-202ENST00000518720 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
TSNARE1-202ENST00000518720 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
TSNARE1-202ENST00000518720 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TSNARE1-202ENST00000518720 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.45■■■□□ 2.47
TSNARE1-202ENST00000518720 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
TSNARE1-202ENST00000518720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.27■■■□□ 2.44
TSNARE1-202ENST00000518720 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.21■■■□□ 2.43
TSNARE1-202ENST00000518720 PRDM2Q13029 1718 aa30.16■■■□□ 2.42
TSNARE1-202ENST00000518720 CFTRP13569 1480 aa30.15■■■□□ 2.42
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.04■■■□□ 2.4
TSNARE1-202ENST00000518720 ERCC6Q03468 1493 aa30■■■□□ 2.39
TSNARE1-202ENST00000518720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30■■■□□ 2.39
TSNARE1-202ENST00000518720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.93■■■□□ 2.38
TSNARE1-202ENST00000518720 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.87■■■□□ 2.37
TSNARE1-202ENST00000518720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
TSNARE1-202ENST00000518720 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.72■■■□□ 2.35
TSNARE1-202ENST00000518720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TSNARE1-202ENST00000518720 WDR62O43379 1518 aa29.6■■■□□ 2.33
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCC8Q09428 1581 aa29.58■■■□□ 2.33
TSNARE1-202ENST00000518720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.56■■■□□ 2.32
TSNARE1-202ENST00000518720 TOPBP1Q92547 1522 aa29.52■■■□□ 2.32
TSNARE1-202ENST00000518720 CUX1P39880 1505 aa29.5■■■□□ 2.31
TSNARE1-202ENST00000518720 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.49■■■□□ 2.31
TSNARE1-202ENST00000518720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
TSNARE1-202ENST00000518720 SYNJ1O43426 1573 aa29.43■■■□□ 2.3
TSNARE1-202ENST00000518720 CUX2O14529 1486 aa29.43■■■□□ 2.3
TSNARE1-202ENST00000518720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.4■■■□□ 2.3
TSNARE1-202ENST00000518720 TOP2BQ02880 1626 aa29.38■■■□□ 2.29
TSNARE1-202ENST00000518720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
TSNARE1-202ENST00000518720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TSNARE1-202ENST00000518720 IFT140Q96RY7 1462 aa29.18■■■□□ 2.26
TSNARE1-202ENST00000518720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.17■■■□□ 2.26
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TSNARE1-202ENST00000518720 SOGA1O94964 1423 aa29.15■■■□□ 2.26
TSNARE1-202ENST00000518720 WDR97A6NE52 1622 aa29.12■■■□□ 2.25
TSNARE1-202ENST00000518720 TRIM41Q8WV44 630 aa29.08■■■□□ 2.25
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TSNARE1-202ENST00000518720 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.03■■■□□ 2.24
TSNARE1-202ENST00000518720 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.02■■■□□ 2.24
TSNARE1-202ENST00000518720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TSNARE1-202ENST00000518720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.92■■■□□ 2.22
TSNARE1-202ENST00000518720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
TSNARE1-202ENST00000518720 PBRM1Q86U86 1689 aa28.89■■■□□ 2.22
TSNARE1-202ENST00000518720 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.85■■■□□ 2.21
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF27Q86VH2 1401 aa28.79■■■□□ 2.2
TSNARE1-202ENST00000518720 GRIN2BQ13224 1484 aa28.77■■■□□ 2.2
TSNARE1-202ENST00000518720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.72■■■□□ 2.19
TSNARE1-202ENST00000518720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.71■■■□□ 2.19
TSNARE1-202ENST00000518720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
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TSNARE1-202ENST00000518720 CHD1O14646 1710 aa28.61■■■□□ 2.17
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TSNARE1-202ENST00000518720 EEA1Q15075 1411 aa28.56■■■□□ 2.16
TSNARE1-202ENST00000518720 IGF1RP08069 1367 aa28.55■■■□□ 2.16
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TSNARE1-202ENST00000518720 SYNJ2O15056 1496 aa28.53■■■□□ 2.16
TSNARE1-202ENST00000518720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.51■■■□□ 2.15
TSNARE1-202ENST00000518720 FBLN2P98095 1184 aa28.49■■■□□ 2.15
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TSNARE1-202ENST00000518720 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.35■■■□□ 2.13
TSNARE1-202ENST00000518720 PRXQ9BXM0 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF21BO75037 1637 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-202ENST00000518720 CEP170Q5SW79 1584 aa28.3■■■□□ 2.12
TSNARE1-202ENST00000518720 OSCARQ8IYS5 282 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-202ENST00000518720 NUP160Q12769 1436 aa28.23■■■□□ 2.11
TSNARE1-202ENST00000518720 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.2■■■□□ 2.11
TSNARE1-202ENST00000518720 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.2■■■□□ 2.1
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